2013年7月12日，美國杜克大學醫學院、多倫多兒童醫院以及深圳華大基因研究院等多家單位通過全基因組測序的方法成功鑒定出一系列與自閉癥相關的遺傳突變和風險基因。該研究成果在《美國人類遺傳學》（the American Journal of Human Genetics）上發表，為自閉癥研究提供了寶貴的遺傳資源，同時或將成為探索自閉癥病理機制及開發新的治療手段極為關鍵的一步。

人們稱自閉癥兒童為“星星的孩子”。自閉癥又稱孤獨癥，是一種由于神經系統失調而導致的發育障礙。每20分鐘就有一個孩子被診斷為自閉癥，目前自閉癥患者已達6700萬。中國的自閉癥患兒也已經超過100萬，且患病率逐年上升。自閉癥的主要病癥包括不正常的社交能力、溝通能力、興趣及行為模式，其病因尚不明確，但發現自閉癥表現出很高的可遺傳性及家族聚集性，但由于其臨床和基因組學異質性，其遺傳基礎目前尚不清楚。

全基因組測序能夠為鑒定自閉癥的新的風險基因以及新生突變提供有價值的信息，但是目前尚未有從全基因組水平對自閉癥做出全面評價。因此，在這項研究中，研究人員對32個自閉癥家系進行了全基因組測序研究，并在全基因組范圍內對單堿基突變（SNV）、拷貝數變異（CNV）以及插入/缺失（indel）等進行檢測，用以鑒定與自閉癥相關由于功能缺失或錯義變化而有害的新生突變或罕見的遺傳性突變。

研究人員在自閉癥先證者中鑒定出19%的新生突變以及31%的伴X染色體或常染色體遺傳性變異。所鑒定出的純系突變比例高于以往的研究報道，這表明全基因組測序更全面的覆蓋到所有位點，同時本研究還進行了外顯子測序，相比之下，全基因組測序能夠更好的對與自閉癥相關的基因進行檢測。

在這項研究中，研究人員共在9個過去已知的與自閉癥相關的基因、4個新發現的自閉癥基因以及8個候選自閉癥風險基因上鑒定出有害的突變。比如與FMR1相配位參與脆性X染色體綜合征的CAPRIN1和AFF2，與社會認知缺陷相關的VIP基因，能夠造成與自閉癥相關的CHARGE綜合征的CHD7基因以及SCN2A、KCNQ2、NRXN1等。

研究還指出，自閉癥全基因組測序的結果可能有助于自閉癥的早期診斷。比如，攜帶有諸如SCN2A和CAPRIN1等新生突變的先證者家族中，后代中再次發病的風險和其他群體相似；而攜帶有一些罕見遺傳變異，如CACNA1C、CHD7、KCNQ2，則出現自閉癥的風險較大。同時伴X連鎖基因發生突變也解釋了自閉癥患者中男性患者居多。此外，所鑒定出的遺傳突變也是很多藥物設計的潛在分子靶點，能夠為自閉癥的個性化治療打開大門，比如VIP基因、KCNQ2等。

華大科技總裁李英睿表示，“全基因組測序是一種強有力的工具，可以加速開發新的診斷和治療手段，從而改善自閉癥患者及其家庭的生活。自閉癥的早期診斷非常重要，有助于患有自閉癥的兒童在語言和社會能力上獲得顯著改善。”

據了解，本研究為由華大基因和美國自閉癥之聲（Autism Speaks）聯合的“10,000個自閉癥基因組研究計劃”（/）的前期項目。該計劃由來自19個國家的50多個研究機構所參與。*階段的目標是完成200名自閉癥兒童及其父母的基因組學研究，目前已經完成了99個加拿大家系的測序。

目前，華大基因旗下子公司——深圳華大健康科技有限公司已正式推出“自閉癥基因檢測”服務，其主要有2種自閉癥基因檢測的方法，即目標區域捕獲測序和全基因組測序。通過自閉癥基因檢測，可以尋找與疾病相關的突變位點，從基因水平上提供自閉癥的直接證據，并進行風險評估，為臨床診斷和早期干預與治療提供科學依據。            來源：華大基因