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美國(guó)科學(xué)家通過(guò)將非天然的氨基酸(除20種用作生物基礎(chǔ)元件的天然氨基酸之外的人造氨基酸)整合入蛋白質(zhì)的多處,成功制造出了新的人造細(xì)菌菌株,其可廣泛應(yīng)用于藥物研發(fā)、藥物合成、生物燃料等領(lǐng)域。研究發(fā)表在9月18日出版的《自然—化學(xué)生物學(xué)》雜志上。
該研究的、加州薩克生物研究所化學(xué)生物學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)室的助理教授王磊(音譯)表示:“研究向我們展示了新的可能性,包括研制出能在血管中持續(xù)更長(zhǎng)時(shí)間的藥物,或采用一種更環(huán)保的方式制造化學(xué)物質(zhì)等。”
添加非天然氨基酸讓蛋白質(zhì)功能更強(qiáng)
2001年,王磊和同事制造出了蛋白質(zhì)中整合了非天然氨基酸的細(xì)菌;2007年,他們?cè)诓溉閯?dòng)物細(xì)胞上運(yùn)用了這項(xiàng)技術(shù)。首先,他們制造出了一個(gè)“擴(kuò)展的遺傳代碼”,并用其覆蓋哺乳動(dòng)物細(xì)胞的遺傳代碼,并指導(dǎo)細(xì)胞在蛋白質(zhì)的構(gòu)建過(guò)程中使用人造氨基酸,從而將人造氨基酸整合進(jìn)蛋白質(zhì)中。
王磊解釋道,添加非天然氨基酸會(huì)改變蛋白質(zhì)的化學(xué)性質(zhì),在藥物研制以及化學(xué)品制造中,新蛋白質(zhì)會(huì)讓得到的產(chǎn)品擁有更加豐富而多樣的功能。
例如,王磊和同事將受到某些顏色的光照時(shí)在顯微鏡下會(huì)發(fā)光的非天然氨基酸插入蛋白質(zhì)中,便可以實(shí)時(shí)觀測(cè)到細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的合成情況,因?yàn)榈鞍踪|(zhì)是大部分細(xì)胞執(zhí)行其功能的基礎(chǔ),這樣就有助于科學(xué)家們描述與疾病或衰老有關(guān)的生物學(xué)機(jī)制。
現(xiàn)在,已有人使用經(jīng)過(guò)基因修改的細(xì)菌來(lái)制藥,例如用其來(lái)合成胰島素以取代動(dòng)物胰腺,供糖尿病患者調(diào)節(jié)其血糖濃度。
將多個(gè)非天然氨基酸嵌入蛋白質(zhì)中
雖然利用DNA(脫氧核糖核酸)重組技術(shù)將非天然氨基酸整合入蛋白質(zhì)中可得到功能更加強(qiáng)大的蛋白質(zhì),但在擴(kuò)展該技術(shù)應(yīng)用范圍的前進(jìn)道路上存在著一個(gè)“攔路虎”——一次只能將一個(gè)非天然氨基酸整合入蛋白質(zhì)中。
為了將一個(gè)整合過(guò)的非天然氨基酸的指令嵌入細(xì)菌的遺傳代碼中,王磊和同事利用了終止密碼子——蛋白質(zhì)遺傳藍(lán)圖中特殊的代碼序列。在蛋白質(zhì)的制造過(guò)程中,終止密碼子會(huì)告訴細(xì)胞機(jī)器停止朝形成蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)骨架的序列增加氨基酸。
2001年,王磊和同事修改了大腸桿菌的遺傳序列,選擇性地將一個(gè)終止密碼子嵌入其遺傳序列中,同時(shí),他們將轉(zhuǎn)基因分子引入細(xì)菌體內(nèi),轉(zhuǎn)基因分子將一個(gè)非天然氨基酸嵌入終止密碼子內(nèi),這使細(xì)菌能產(chǎn)生有非天然氨基酸集成于其骨架內(nèi)的蛋白質(zhì)。
問(wèn)題在于,名為釋放因子1(RF1)的蛋白質(zhì)會(huì)阻止包含非天然氨基酸的蛋白質(zhì)產(chǎn)生。盡管科學(xué)家們能為非天然氨基酸將終止密碼子插在遺傳序列的多個(gè)地方,然而,釋放因子會(huì)在*個(gè)終止密碼子那兒讓蛋白質(zhì)死亡,以預(yù)防包含多個(gè)非天然氨基酸的長(zhǎng)蛋白質(zhì)產(chǎn)生。
“為了真正地利用該技術(shù),科學(xué)家需要能對(duì)多處含有非天然氨基酸的蛋白質(zhì)進(jìn)行遺傳修改,地制造出這些蛋白質(zhì)。”王磊說(shuō),“這一點(diǎn)極富潛力,但此前還沒(méi)有變成現(xiàn)實(shí)。”
在研究中,薩克生物研究所的科學(xué)家和加州大學(xué)的同行解決了這個(gè)問(wèn)題。既然RF1會(huì)抑制包含多個(gè)非天然氨基酸的長(zhǎng)蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,所以,科學(xué)家們剔除了產(chǎn)生RF1的基因。但RF1基因被移除后,大腸桿菌就會(huì)死亡,因此科學(xué)家們制造出了RF1的“替身”釋放因子2(RF2),RF2能讓剔除RF1后的細(xì)菌“*”。結(jié)果,科學(xué)家們得到了一個(gè)能有效地將非天然氨基酸整合在多處蛋白質(zhì)的細(xì)菌。
人造細(xì)菌具有巨大應(yīng)用潛力
這些合成出來(lái)的細(xì)菌在藥物研發(fā)領(lǐng)域擁有巨大的潛力,據(jù)此研制出的藥物擁有的生物學(xué)功能將遠(yuǎn)超只包含天然氨基酸的蛋白質(zhì)。這些分子或許也能作為基礎(chǔ)元件,制造從工業(yè)溶劑到生物燃料在內(nèi)的任何產(chǎn)品,幫助解決與石油生產(chǎn)和運(yùn)輸有關(guān)的經(jīng)濟(jì)和環(huán)境問(wèn)題。
“這是我們制造出一個(gè)可用的、擁有多處包含非天然氨基酸的蛋白質(zhì)的細(xì)菌菌株。”王磊說(shuō),“盡管這項(xiàng)技術(shù)還有改進(jìn)空間,但這使科學(xué)家們?cè)谏锕こ虒W(xué)領(lǐng)域使用非天然氨基酸幾乎就快成為現(xiàn)實(shí)了。”
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