重組DNA轉化受體細胞后，須在不同水平上進行篩選，以區別轉化子與非轉化子、重組子與非重組子以及鑒定所需的特異性重組子。在轉化過程中，并非每個受體細胞都被轉化；即使獲得轉化細胞，也并非都含有目的基因，所以需采用有效方法進行篩選。篩選的方法包括根據遺傳表型篩選、限制性內切酶分析篩選、核酸探針篩選、PCR篩選等。本實驗采用遺傳表型篩選中的抗生素平板篩選或α互補篩選的方法。
一、抗生素平板篩選
【實驗原理】
目標基因是Kan的抗性基因，而載體含Amp 的抗性基因，因此在含有Amp 和Kan的培養基中生長的菌落即為陽性菌落。
【操作步驟】
1．制備含有Amp 和 Kan 的LB瓊脂培養板
2．將100μl 轉化菌液用無菌涂布器均勻涂布于含有Amp 和Kan培養板上，37℃培養12-16h 。
3．在含有Amp和Kan培養板上能生長的菌落即為陽性重組質粒。并將其接種于含Kan的LB液體培養基2ml中培養8-16h。
4．小量制備質粒，限制性酶切分析進一步鑒定。
二、α互補篩選
【實驗原理】
適用于含有半乳糖苷酶基因（LacZ）的載體，如 pUC系列等，其原理是：載體含有LacZ的調控序列和N端146個氨基酸的編碼信息。在這個編碼區中插入了一個多克隆位點。當這種載體進入可編碼β-半乳糖苷酶C端部分序列的宿主細胞后（質粒和宿主細胞編碼的片段各自都沒有酶活性），它們可以融為一體，形成具有酶學活性的蛋白質，這種現象叫α互補。由α互補而產生的 Lac+ 細菌在呈色底物 5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷（X-gal）和誘導劑異丙基硫代-β-D-半乳糖苷（IPTG）存在下形成藍色菌落。當外源DNA插入到質粒的多克隆位點后，導致產生無α互補能力的氨基端片段。因此，帶有重組質粒的細菌形成白色菌落。通過呈色反應即可初步識別可能帶有重組質粒的菌落。通過小量制備質粒DNA進行限制酶切分析，即可確定這些質粒的結構。
【試劑】
1．X-gal（20mg／m l）：將20mg X-gal溶于l ml二甲基甲酰胺中，-20℃避光保存。
2．IPTG（200mg／ml）：將1g IPTG溶于4 ml去離子雙蒸水中，定容至5 ml，用0.22μm過濾器除菌，-20℃保存備用。
【操作步驟】
1．制備含相應抗生素的瓊脂平板。
2．于平板表面加 X-gal 40μl 和IPTG 4μl，并用無菌玻璃涂布器將試劑均勻涂布于整個平板表面。37℃靜置l h。
3．
將100μl 轉化的菌液涂布于平板表面，置37℃培養箱20 min后，倒置平板繼續培養12～16h。
4．中止培養后，將平板靜置4℃ 4h，使藍色充分顯現，平皿上顯示藍色和白色兩種菌落。
5．挑取白色菌落置2 ml LB（含相應抗生素）液體培養基中，37℃搖床培養8～12h。
6．提取質粒，以限制性酶切分析進一步鑒定。
