溴酚藍是一種pH 指示劑，在pH 3.0~4.6范圍，顏色由黃變藍。pH=3.0時呈黃色，pH=4.6時呈藍紫色。常用做電泳指示染料，凝膠中電泳遷移速度在小分子核酸或蛋白質區域。還可用作酸堿指示劑；非水滴定用指示劑，蛋白電泳染色；病毒化驗等。

溴酚藍性狀：從乙酸及丙酮混合液中析出者為長六角形棱柱狀結晶。近似黃色或淺玫瑰色結晶性粉末，微溶于水及乙醚，溶于乙醇或稀堿液及氨液中呈藍色。PH變色范圍 3.0（黃）~4.6（藍紫） 微溶于水，易溶于甲醇、乙醇和苯，可自由溶于氫氧化鈉溶液，同時形成溴酚藍鈉鹽水溶液。

溴酚藍指示液：取溴酚藍0.1g，加0.05mol/L氫氧化鈉溶液3.0ml使溶解，再加水稀釋至200ml，即得。變色范圍：pH2.8～4.6（黃～藍）

溴酚藍有3種配置方法：

1、1%的溴酚藍：將托盤天平上稱取1g溴酚藍定溶于100ml無水乙醇中，轉移入滴瓶中，貼標簽備用。

2、0.05%的溴酚藍 ：配western blot用的2*SDS上樣緩沖液需要用到0.1%的溴酚藍，2-DE中溴酚藍一般也是配成0.1%母液。實際上，溴酚藍在水中的溶解度不高，直接將0.1g溴酚藍溶于100ml水是有困難的。下面是其較合適的配制方法： 0.05%的溴酚藍配制方法：取溴酚藍0.1g，加0.05mol/L氫氧化鈉溶液3.0ml使溶解，再加水稀釋至200ml，即得。 變色范圍pH2.8～4.6（黃→藍綠）。只是不知道加入NaOH會不會影響2-DE實驗。估計影響不大，因為指示劑用量畢竟很少。

3、1％溴酚藍 ：加1g水溶性鈉型溴酚藍于100ml水中，攪拌或渦旋混合直到*溶解。溴酚藍其鈉鹽易溶解在水里。