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根據《實驗室—生物安全通用要求》和《生物安全實驗室建筑技術規范》GB50346的規定，把生物安全實驗室分為四級，其中一級對生物安全隔離的要求zui低，四級zui高。生物安全實驗室中污染風險zui高的房間，通常按有生物安全柜、動物隔離器等設備，稱為主實驗室或核心實驗室。
生物安全實驗室的空氣凈化主要有：
1、生物安全實驗室一級可自然通風，二級可采用帶循環風的空調系統，涉及有毒有害等操作，采用全排風。
2、三、四級實驗室防護區應采用全新風。
3、凈化空調系統用在新風口、風機正壓段和送風末端設三級空氣過濾。其中新風過濾適當的大氣塵污染情況可用粗效+中效過濾器或粗效+中效+高中效或亞過濾器。
4、三、四級實驗室必須設室內排風口，并在進風口處安裝國標B類以上過濾器同時應具備現場原位掃描檢測和消毒的條件。四級實驗室應有兩道排風過濾器。
5、宜采用上送下排氣流組織，但飼養大動物的生物安全實驗室宜采用上送下排方式。
6、在排風過濾器與排風機之間應安裝氣密閥。
7、排風應先于送風開啟，后于送風關閉，送排風連鎖。排風機應有備用。
8、保持生物安全實驗室的負壓差，是空氣凈化的zui主要的任務，保證氣流由輔助區流向防護區。對動物安全實驗室 負壓的要求又高于普通生物安全實驗室，因為動物源性的污染是zui危險的污染源。
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