系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)展歷史
實(shí)驗(yàn)方法與系統(tǒng)方法構(gòu)成科學(xué)研究的基本方法，19世紀(jì)是實(shí)驗(yàn)生物學(xué)（生態(tài)、生理、遺傳與醫(yī)學(xué)等）范式建立，20世紀(jì)是實(shí)驗(yàn)生物學(xué)迅速發(fā)展和系統(tǒng)生物學(xué)（生態(tài)、生理、遺傳與醫(yī)學(xué)等）范式形成。系統(tǒng)科學(xué)（包括控制論、信息論）根源于生命科學(xué)，發(fā)展了計(jì)算機(jī)科學(xué)而又應(yīng)用于生物科學(xué)，將開(kāi)發(fā)出生物計(jì)算機(jī)。維納與香農(nóng)從動(dòng)物與通訊行為的研究中提出控制論與信息論，整個(gè)系統(tǒng)科學(xué)根植于有機(jī)體哲學(xué)思維。系統(tǒng)生物學(xué)，zui初開(kāi)創(chuàng)于貝塔郎菲的一般系統(tǒng)理論與理論生物學(xué)，艾根的超循環(huán)理論發(fā)展了細(xì)胞、生物化學(xué)與分子層次的系統(tǒng)論。20世紀(jì)70年代召開(kāi)了“系統(tǒng)論與生物學(xué)” （systems theory and biology） 會(huì)議，80年代召開(kāi)了生物化學(xué)系統(tǒng)論、生物系統(tǒng)的計(jì)算機(jī)模型等探討的會(huì)議 （第11屆分子系統(tǒng)生物學(xué)會(huì)議2009 年6 月于中科院上海召開(kāi)）。系統(tǒng)生物學(xué)的概念在20世紀(jì)中葉已經(jīng)提出，合成生物學(xué)的概念提出于基因重組技術(shù)的產(chǎn)生，進(jìn)化理論、有機(jī)分子合成可以說(shuō)是zui早的探索。
系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)展經(jīng)歷了三個(gè)歷史時(shí)期：*期，生態(tài)系統(tǒng)，系統(tǒng)生態(tài)學(xué)與行為、心理學(xué)，開(kāi)始于 20 世紀(jì)60~70 年代；第二期，生理系統(tǒng)，系統(tǒng)生理學(xué)與神經(jīng)、內(nèi)分泌、免疫學(xué)，開(kāi)始于20世紀(jì)70~80年代；第三期，遺傳系統(tǒng)，系統(tǒng)遺傳學(xué)與胚胎、發(fā)育生物學(xué)，系統(tǒng)遺傳學(xué)的概念與詞匯于20 世紀(jì)90 年代中科院曾邦哲（曾杰）發(fā)表，并于1996年主辦第1 屆轉(zhuǎn)基因動(dòng)物學(xué)術(shù)研討會(huì)（秘書(shū)長(zhǎng)）闡述了系統(tǒng)論與生物工程、輸卵管生物反應(yīng)器及基因組進(jìn)化與生物體發(fā)育自組織系統(tǒng)理論，遺傳學(xué)從染色體行為的細(xì)胞遺傳學(xué)、基因表達(dá)信息流的分子遺傳學(xué)，發(fā)展到了系統(tǒng)遺傳學(xué)的細(xì)胞發(fā)生信號(hào)傳導(dǎo)與基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究，并重新于第19屆遺傳學(xué)大會(huì)闡述（包括指出C. Nuslein-Volhard、S. Brenner[7]等是較早以systematic方法研究遺傳學(xué)的科學(xué)家）。2008 年3 月美國(guó)加州舉辦了整合與系統(tǒng)遺傳學(xué)會(huì)議，2009 年10月荷蘭召開(kāi)了系統(tǒng)遺傳學(xué)研討會(huì)。 1999 年初于德國(guó)建立系統(tǒng)生物科學(xué)與工程網(wǎng)及籌備聯(lián)合協(xié)會(huì)、會(huì)議等 （1999 年10 月Nature 和12 月Kybernetes），曾邦哲（ZengBJ）定義生物系統(tǒng)理論與實(shí)驗(yàn)、計(jì)算 （computational）、工程方法的生物系統(tǒng)分析與人工生物系統(tǒng)研究，并闡述其自組織系統(tǒng)結(jié)構(gòu)理論基礎(chǔ)，1999-2000年將籌備通知發(fā)送到系統(tǒng)科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、納米科學(xué)、生物醫(yī)學(xué)、生物工程等廣泛領(lǐng)域的科學(xué)家（包括邀請(qǐng)C. Nuslein-Volhard、Tomita等科學(xué)家），細(xì)胞是由大規(guī)模生物分子（納米）構(gòu)成的復(fù)雜生物系統(tǒng)，基因組是可以重編程序的智能系統(tǒng)，生命系統(tǒng)人工設(shè)計(jì)與改造，可以開(kāi)發(fā)出細(xì)胞生物機(jī)器。 2000 年同期，日本Kitnano 和Tomita 舉辦系統(tǒng)生物學(xué)會(huì)議，美國(guó)Hood 建立系統(tǒng)生物學(xué)研究所，美國(guó) Kool 重新提出合成生物學(xué)的概念。2001年WolkenhauerO.6月（9月出版）、Ideker T & Hood L9月和Kitano H.10月（MIT出版2000年會(huì)議論文集）等發(fā)表文章論述系統(tǒng)生物學(xué)的系統(tǒng)論、組學(xué)和計(jì)算方法等，2002年日本北野宏明（Kitano H.）[8]、2003年美國(guó)胡德（Hood L.）[9]也論述了系統(tǒng)生物學(xué)是實(shí)驗(yàn)與計(jì)算方法整合的生物系統(tǒng)研究，2008年Nature文章[10]則論述了系統(tǒng)生物學(xué)與合成生物學(xué)的結(jié)構(gòu)理論。2005年Ideker贊同是如同Kitnano的分子水平的系統(tǒng)生物學(xué)概念，2007年Kinano闡釋系統(tǒng)生物學(xué)是在分子生物學(xué)層次的重新提出。計(jì)算生物技術(shù)、組學(xué) （omics） 生物技術(shù)與合成生物技術(shù)，構(gòu)成系統(tǒng)生物學(xué)發(fā)展的技術(shù)基礎(chǔ) - 系統(tǒng)生物技術(shù) （systems biotechnology），現(xiàn)代系統(tǒng)生物學(xué)是生物系統(tǒng)的理論與技術(shù)整合的研究體系。21 世紀(jì)伊始，刊物 Nature、Science 發(fā)表系統(tǒng)生物學(xué)、合成生物學(xué)等專刊，終于進(jìn)入了系統(tǒng)生物科學(xué)（簡(jiǎn)稱系統(tǒng)生物學(xué)）化迅速發(fā)展時(shí)代。
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