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上海酶聯生物研究所
閱讀:258發布時間:2012-7-11
25年前,當人類基因組計劃剛啟動時,人們認為這項解讀“人體構成說明書”的工程,要數百臺測序儀、耗資30億美元和15年的時間才能完成。2003年,*套人類基因組序列的測序工作順利完成,但這項重大科學成果還只是一套粗略的草圖,其中還有巨大的空白需要*。
時間飛逝,2012年1月,美國拉斯韋加斯消費電子產品展,在琳瑯滿目的和平板電視之中,zui吸引人眼球的是一款基因測序儀Ion Proton,這臺白色的電器跟打印機大小相仿。它的稱,這款測序儀將于今年推向市場,它能在幾小時之內,以1 000美元的價格完成一個人的全基因組測序,而1 000美元只相當于一臺不錯的等離子電視的價格。
人們一直都把1 000美元的基因測序作為一個轉折點,認為它預示著個性化醫療時代的來臨。基因測序的成本降到了這樣的程度,醫生就可以根據患者*的遺傳特征和藥物敏感性來治療心臟病、癌癥和其他疾病。隨著這樣的基因測序儀走向市場,行業觀察家們預測,對普通人進行綜合遺傳檢測的時代已經來臨。
但是,也有一些人認為,這項技術還不成熟,不適合廣泛應用。美國約翰斯·霍普金斯大學醫學中心的遺傳學教授阿拉文達·查克拉瓦提(Aravinda Chakravarti)擔心,個體化基因組醫學的好處被夸大了。而且,人們沒有意識到,目前不論是通過醫生,還是在網上購買的全基因組測序結果都沒有實際的醫學價值。
主要問題是,這項技術發展得太快,研究人員對測序結果的解讀能力沒有跟上。例如,每個人的基因測序結果都必須與大量的其他人的測序結果進行比較,這樣醫生才能知道哪些是重要的疾病指標,哪些則可以忽視。另外,許多疾病是由一些罕見突變造成的,而科學家還沒有鑒別出這些突變。zui后,即使只是對一次基因組測序的結果進行簡單分析,也是一件讓人頭疼的事情。美國斯坦福大學醫學院的心臟病學副教授歐安·A·阿什利(Euan A. Ashley)說:“現在,基因測序已經是既快速又便宜。但是,分析數據卻讓人頭疼,既不快速,也不便宜。”
為了說明這個過程會有多么復雜,阿什利和斯坦福大學、哈佛大學的幾位研究人員分析了他們一位同事、生物工程學教授斯蒂芬·奎克(Stephen Quake)的基因組序列。即使奎克早已測出了自己的基因組序列,有了原始數據,幾位科學家也花費了整整6個月時間來思考,這項工作應該如何進行。
在奎克的家族史中,有幾例心臟病患者。果然,研究小組發現,他擁有幾個基因突變,都與心臟病的發作風險有關。這次分析還有一些意外發現,比如研究人員發現,奎克患上一種名為血色素沉著癥(hemochromatosis)的遺傳性血液疾病的風險有所增高,但奎克的家族中,還沒有人得過這種病。目前還不能確定的是,這個意外發現確實是患病風險升高的反映,還是測序過程出了錯。
盡管有這些問題,阿什利還是樂觀地認為,把個體化的DNA測序結果應用于臨床是可能的。他認為總有一天,個人的基因組序列將成為電子病歷上的常規內容。但到目前為止,受益于全基因測序的那一小部分病人,大多具有罕見而明顯的基因突變。這對于我們其他人有什么樣的意義呢?我們拭目以待。
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