為了延長泵的使用壽命和維持其輸液的穩定性，必須按照下列注意事項進行操作：
1、防止任何固體微粒進入泵體，因為塵埃或其它任何雜質微粒都會磨損柱塞、密封環、缸體和單向閥，因此應預先除去流動相中的任何固體微粒。流動相好在玻璃容器內蒸餾，而常用的方法是濾過，可采用濾膜等濾器。的濾器應經常清洗或更換。
2、流動相不應含有任何腐蝕性物質，含有緩沖液的流動相不應保留在泵內，尤其是在停泵過夜或更長時間的情況下。
3、泵工作時要留心防止溶劑瓶內的流動相被用完，否則空泵運轉也會磨損柱塞、缸體或密封環，終產生漏液。
4、的工作壓力決不要超過規定的高壓力，否則會使高壓密封環變形，產生漏液。
5、流動相應該先脫氣，以免在泵內產生氣泡，影響流量的穩定性，如果有大量氣泡，泵就無法正常工作。
如果產生故障，須查明原因，采取相應措施排除故障：
1、沒有流動相流出，又無壓力指示。原因可能是泵內有大量氣體，這時可打開泄壓閥，使泵在較大流量(如5ml/min)下運轉，將氣泡排盡，也可用一個50ml針筒在泵出口處幫助抽出氣體。另一個可能原因是密封環磨損，需更換。
2、壓力和流量不穩。原因可能是氣泡，需要排除；或者是單向閥內有異物，可卸下單向閥，浸入丙酮內超聲清洗。有時可能是砂濾棒內有氣泡，或被鹽的微細晶粒或滋生的微生物部分堵塞，這時，可卸下砂濾棒浸入流動相內超聲除氣泡，或將砂濾棒浸入稀酸(如4mol/L硝酸)內迅速除去微生物，或將鹽溶解，再立即清洗。
3、壓力過高的原因是管路被堵塞，需要清除和清洗。壓力降低的原因則可能是管路有泄漏。檢查堵塞或泄漏時應逐段進行。
