目前,在分析儀器中，色譜儀器具有重要地位。由于色譜儀的色譜柱具有高效的分離能力，把物質(zhì)按保留時(shí)間大小進(jìn)行分離，然后通過與標(biāo)樣保留時(shí)間進(jìn)行對(duì)比的方法確定物質(zhì)性質(zhì)，因此對(duì)未知樣品很難定性分析。
而質(zhì)譜聯(lián)用儀是直接測(cè)定物質(zhì)的質(zhì)量數(shù)與電荷的比值(m/z)在定性分析方面既準(zhǔn)確又快速。把色譜與質(zhì)譜聯(lián)合起來使用，實(shí)際上是把質(zhì)譜儀作為色譜儀的一個(gè)通用檢測(cè)器來使用。
色譜儀有很多檢測(cè)器，如TCD、FID、ECD、FPD、NPD等，每種檢測(cè)器只有一定限度的適用范圍，不能通用，造成使用不便。而質(zhì)譜儀作為質(zhì)量檢測(cè)器可以取代色譜儀的多種檢測(cè)器，通用性強(qiáng)，使用極其方便。
所以說色-質(zhì)聯(lián)用儀器把色譜的高效分離作用與質(zhì)譜計(jì)對(duì)未知樣品的準(zhǔn)確鑒別能力相結(jié)合，把分析儀器提高到一個(gè)新水平，凡是能使用色譜儀的地方，均可以使用色-質(zhì)聯(lián)用儀器。
色-質(zhì)聯(lián)用儀器在當(dāng)前儀器分析中占有非常突出的地位。色-質(zhì)聯(lián)用儀器是色譜技術(shù)、質(zhì)譜技術(shù)與計(jì)算機(jī)技術(shù)三種現(xiàn)代化技術(shù)緊密結(jié)合的產(chǎn)物。
為了質(zhì)譜儀器的正常工作，必須要組成高真空系統(tǒng)的真空室。儀器使用了高性能的渦輪分子泵與前級(jí)真空泵構(gòu)成兩級(jí)真空機(jī)組以確保所需的真空。
被分析樣品經(jīng)毛細(xì)管柱分離，進(jìn)入離子源。采用電子電力標(biāo)準(zhǔn)配置(EI)，產(chǎn)生正離子，在推斥、聚焦、引出電極的作用下將正離子送入四極桿系統(tǒng)。
四極桿在高頻電壓與正負(fù)電壓聯(lián)合作用下形成高頻電場(chǎng)，在掃描電壓作用下，只有符合四極場(chǎng)運(yùn)動(dòng)方程的離子才能通過四極桿對(duì)稱中心到達(dá)離子檢測(cè)器，再經(jīng)離子流放大器放大，產(chǎn)生質(zhì)譜信號(hào)。
得到了質(zhì)譜圖，通過解釋譜圖或進(jìn)行譜庫(kù)檢索以識(shí)別未知樣品的組成。
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