zui近，美國(guó)楊百翰大學(xué)的研究人員，開(kāi)發(fā)出了一種新的人類基因組組裝方法，并無(wú)意中發(fā)現(xiàn)了一種新的方法，可識(shí)別幾種常見(jiàn)遺傳病中難以捉摸的標(biāo)記。延伸閱讀：基因組組裝可縮短至幾分鐘？。
這種新方法依賴于研究人員開(kāi)發(fā)的一種新算法，這種方法對(duì)于DNA序列中特定類型的變異，更為敏感。
本文*作者、計(jì)算機(jī)科學(xué)博士Paul Bodily指出：“這需要堅(jiān)持不懈，結(jié)果并不是我原本打算調(diào)查的。我只是繼續(xù)沿著一條路，不知道它將要去哪里，直到我發(fā)現(xiàn)有閃亮的東西出現(xiàn)。”
每個(gè)人在其每個(gè)細(xì)胞中都有各自基因組的2個(gè)拷貝，每個(gè)拷貝都來(lái)自親本一方。兩個(gè)拷貝的序列是相同的，但有時(shí)也有一段序列被反轉(zhuǎn)，稱為倒位（inversion）。
倒位往往是有生物學(xué)意義的。以前的研究已經(jīng)表明，倒位和精神發(fā)育遲滯、糖尿病、癲癇，精神分裂癥和自閉癥之間存在一種關(guān)聯(lián)。
該研究結(jié)果發(fā)表在生物信息學(xué)雜志《Bioinformatics》上，詳細(xì)介紹了這種新算法的性能如何優(yōu)于其他方法，并意外發(fā)現(xiàn)了這種新算法檢測(cè)倒位的能力。
此前，檢測(cè)倒位是非常困難的，但是研究人員認(rèn)為，他們的方法可以顯著提高這一檢測(cè)過(guò)程。
本文資深作者、計(jì)算機(jī)科學(xué)教授Mark Clement指出：“有些疾病，如自閉癥，我們真的不確定是什么原因造成的。至少有改進(jìn)的工具用于檢測(cè)可能的原因，是很重要的。”
該研究小組讓這種新算法源，可以自由提供給任何其他想要應(yīng)用它的研究人員。Bodily離畢業(yè)還有幾年，但他預(yù)期將在一個(gè)更大的范圍內(nèi)，應(yīng)用這一新的模塊。
Bodily說(shuō)：“如果你制定正確的數(shù)據(jù)，你可以產(chǎn)生幾乎所有看上去很好的算法，但是我們的算法是基于一些非常基本的理論。理論和實(shí)踐往往不是一致的，但我非常希望，當(dāng)我們的方法適用到更大的前景時(shí)，將很好的發(fā)揮作用。”
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