革蘭氏染色法是細菌學中廣泛使用的一種鑒別染色法，通過結晶紫初染和碘液媒染后，在細胞壁內形成了不溶于水的結晶紫與碘的復合物，革蘭氏陽性菌細胞壁較厚，肽聚糖網層次較多且交聯致密，乙醇脫色時，肽聚糖脫水使孔徑縮小，故保留結晶紫-碘復合物在細胞膜上，呈紫色。革蘭氏陰性菌細胞壁薄、外膜層類脂含量高、肽聚糖層薄且交聯度差，脫色后類脂外膜迅速溶解，縫隙加大，結晶紫與碘復合物溶出，因此乙醇脫色后再經番紅復染，呈紅色。

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