紫外線消毒器是紫外線波長在240~280nm范圍內具殺破壞細菌病毒中的DNA(脫氧核糖核酸)或RNA(核糖核酸)的分子結構，造成生長性細胞死亡和(或)再生性細胞死亡，達到殺菌消毒的效果。尤其在波長為253.7時紫外線的殺菌作用強。此波段與微生物細胞核中的脫氧核糖核酸的紫外線吸收和光化學敏感性范圍重合，
如下圖。圖中顯示核糖核酸和脫氧核糖核酸的吸收光譜的范圍為240~280nm，吸收峰在260nm。通常認為紫外線能改變和破壞結構突變，改變了細胞的遺傳轉錄特性，使生物體喪失蛋白質的合成和復制繁殖能力，其他的蛋白質吸收(苯基*、*和*中的芳香環的吸收峰為280nm)也可能對紫外線的殺菌過程發揮作用。 一般日光穿透大氣層后達到地面的紫外線的波長為287~390nm，偏離紫外線的殺菌波長范圍(約250~285nm)。主要是大氣臭氧層的吸收作用使日光光譜中低于290nm的紫外線強度速度減少，故日光的殺菌能力遜于的紫外線殺菌燈。
紫外線消毒器用途廣泛，在水處理中具有很高的價值，它是通過紫外光線的照射，破壞及改變微生物的DNA(脫氧核糖核酸)結構，使細菌當即死亡或不能繁殖后代，達到殺菌的目的。真正具有殺菌作用的是UVC紫外線，因為C波段紫外線很易被生物體的DNA吸收，尤以253.7nm左右的紫外線。紫外線消毒器屬于純物理消毒方法，具有簡單便捷、廣譜、無二次污染、便于管理和實現自動化等優點，隨著各種新型設計的紫外線燈管的推出，紫外線殺菌的應用范圍也不斷在擴大。優點 1、率殺菌:紫外線對細菌、病毒的殺菌使用一般在一至二秒即可達到99%-99.9%的殺菌率。 2、殺菌廣譜性:紫外線殺菌的廣譜性是高的，它對幾乎所有的細菌、病毒都能率殺滅。 3、無二次污染: 紫外線殺菌不加入任何化學藥劑，因此它不會對水體和周圍環境產生二次污染，不改變水中任何成分。 4、運行安全、可靠: 傳統的消毒技術如采用氯化物或臭氧，其消毒劑本身就是屬于劇毒、易燃的物質，而紫外線消毒系統不存在這樣的安全隱患
