酵母菌是單細胞的真核微生物。酵母菌的有性繁殖是通過形成單倍體的子囊孢子的方式進行的。酵母菌存在單倍體和二倍體的生活史，具有孟德爾式的分離現象，以及a和a接合型．具有這兩種接合型的子囊孢子萌發生長成單倍體的菌株，不同接合型的單倍體菌株細胞可以接合生成二倍體菌株。酵母菌二倍體的生活力較單倍體強，生產能力也明顯高于單倍體，因此通過雜交得到二倍體，有可能達到育種的目的。

    酵母菌的雜交主要是通過有性雜交，有性雜交是利用兩種不同接合型的單倍體菌株或子囊孢子進行的。有的酵母菌如假絲酵母不具有性生殖，即不產生子囊孢子，它們的雜交與霉菌一樣，是通過準性生殖過程進行的。酵母菌雜交一般指異接合型菌株的雜交。雜交過程包括子囊孢子接觸、接合、合子形成．直至二倍體細胞出芽為止的一系列過程。雜交步驟包括遺傳標記菌株的選擇和不同遺傳標記的異接合型細胞雜交。

1.標記親株的選擇

    酵母菌雜交育種的親株要求攜帶遺傳標記，常用的遺傳標記為營養缺陷型或抗性突變型，也可以是菌落和細胞的形態。選擇標記親本菌株一般是先選擇遺傳性狀優良的原始親本，然后從兩個原始親本中選出不同接合型的單倍體菌株或者單倍體的子囊孢子，采用適合的誘變劑處理單倍體菌株，從中獲得帶有不同營養缺陷基因的親本菌株作為雜交的直接親本。

2.雜交方法

(1)子囊孢子的制備酵母菌二倍體細胞在營養貧乏的產孢子培養基上培養可形成子囊孢子。通常子囊孢子不易分離，可用蝸牛酶處理，振蕩，加液體石蠟，搖勻后子囊孢子就聚集于液體石蠟層中；或洗下子囊．加液體石蠟和硅膠土，研磨，4500r／min離心10min，破壁后被分離的子囊孢子集中到石蠟層。取含有子囊孢子的石蠟，再加人等量的15％明膠．混勻后涂布到瓊脂平板上培養，即可得到單倍體菌落，移人斜面，備用。

    酵母菌單倍體細胞與二倍體細胞在形態上存在一定的區別。二倍體細胞較大，呈橢圓形；菌落大且形態較一致；液體培養繁殖快，細胞較分散；在孢子培養基上可形成子囊。而單倍體細胞較小，呈球形；菌落小并且形態多變；液體培養時繁殖慢，細胞聚集成團；在孢子培養基上不形成子囊。單倍體細胞具有接合能力，但不能形成孢子。根據在產孢子培養基上能否形成子囊孢子可以確定是否為單倍體細胞。將單倍體菌株與已知接合型a或a標準單倍體細胞雜交，確定單倍體細胞的接合型。

(2)有性雜交 酵母菌有性雜交的方法主要有孢子雜交法、群體雜交法和單倍體細胞雜交法三種。

①孢子雜交法在顯微操作器下．取單個子囊孢子．隨機配對，置于微滴培養液中培養，子囊孢子發芽并發生接合，形成接合子。

②群體雜交法把帶有遺傳標記的兩種不同接合型單倍體細胞移接到*培養液中，混合培養過夜，使兩親本細胞在生長中充分接合，然而把混合液分離在選擇培養基或基本培養基上，培養后形成二倍體的雜種菌落。

③單倍體細胞雜交法將兩種不同接合型的單倍體細胞在顯微操作器下隨機配對，進行微滴培養。在顯微鏡下可直接觀察雜合子形成，并可在無遺傳標記的情況下獲得雜合二倍體細胞。

    酵母菌和其他微生物雜交一樣，種間雜交比屬間雜交容易獲得優良性狀的重組體。這是因為種問雜交的遺傳特性比較穩定，而屬間雜交產物易于發生遺傳分離造成的。