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實驗步驟
1. 蛋白質雙向電泳
1) *向固相pH梯度等電聚焦電泳
a. 上樣:*向等電聚焦采用膠內加樣的方法進行。吸取一定量的蛋白樣品(銀染樣品的蛋白上樣量為140 ug計,考染樣品為1.3 mg)加入重泡漲液(8 mol/L尿素,2%CHAPS,痕量濱酚藍,20 mmol/L DTT,0.5 % IPG buffer),使終體積達到350ul。混勻后均勻加在IPG膠條holder的正、負極之間。將預制IPG膠條(pH 3 -10 NL)除去保護膜,膠面向下,覆于holder中的樣品之上;慢慢下壓膠條,并前后移動,避免生成氣泡。在膠條上方均勻封以1 ml覆蓋油,蓋上蓋子。
b. 等電聚焦:將裝有樣品和IPG膠條的strip holder置一向電泳儀(IPGphorTM Isoelectric Focusing System)上進行等電聚焦。等電聚焦參數:0V電壓下泡漲3h,30V電壓下泡漲10 h,500 V電壓下電泳0.5 h,2000V電壓下電泳0.5 h,5000 V電壓下電泳0.5 h,8000 V電壓下電壓20 h。
c. 膠條的平衡:*向電泳結束后,取出IPG膠條平衡兩次,每次15 min。平衡緩沖液(50 mol/L Tris buffer pH 8.8,6 mol/L尿素,30甘油,0.8 g澳酚藍,20 mmol/L DTT,含2 % (w/v) SDS)可減少電內滲,有利于蛋白質從*向轉移到第二向。在第二步平衡中用100mmol/L碘乙酞胺代替DTT以除去*步平衡時的DTT。平衡后的IPG膠條沿邊緣用濾紙吸去多余的平衡液。
2) 第二向垂直SDS-PAGE
根據IPG conversion Kit的體積,配制大小為200 mmX200 mmX 1mm,濃度為12.5%T,3.3%C的均勻膠。將平衡好的IPG膠條移至凝膠上方,用0.5%瓊脂糖電泳緩沖液封閉。電泳的緩沖液系統為Tris-Glycine-SDS系統(500 ml,SX,7.5 g Tris,2.5 g SDS,36 g Glycine)。一向膠條和二向膠接觸面避免氣泡產生;封膠溫度不能過高,封膠時不要引入氣泡。
電泳參數設置:14-15℃恒溫下,以每膠條計
20 mA恒流電泳40 min
30 mA恒流電泳至澳酚藍電泳到底部。
2. 染色
1) 銀染法:將二向電泳完成后的SDS-PAGE轉移至固定液(40%無水乙醇,10%冰醋酸)中,固定30 min;棄固定液換敏化液(30%無水乙醇,6.8%醋酸鈉,0.2%*,0.5%戊二醛)敏化30 min;棄敏化液,以雙蒸水200 ml洗2次,每次30 min;之后置于銀染液((0.25%*,40%甲醛)染色20 min,染色時避光;棄銀染液,以雙蒸水200ml洗2次,每次1 min;顯色液((2.5%碳酸鈉,20%甲醛)顯色2-5 min,至蛋白質點*顯現為止;棄顯色劑,立即換終止液(1.46 %EDTA),終止顯色10 min;以超純水洗3次,每次5 min。
2) 考馬斯亮藍染色(考染)法:將二向電泳完成后的SDS-PAGE轉移至固定液(50%無水乙醇,10%冰醋酸的水溶液)中,固定30 min以上;棄固定液,加入染色液(10%冰醋酸,G-350過濾所得),熱染10 min;之后轉移至脫色液中(10%冰醋酸水溶液)過夜,直至背景色脫盡;超純水清洗。
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