在免疫酶電鏡技術中，由于過氧化物酶催化H2 O2 與DAB的反應產物多呈彌散分布，常使被檢抗原在組織或細胞內的超微結構定位模糊不清。而膠體金免疫電鏡術所用的膠體金對許多蛋白質均具有較強的親和力，盡管研究者們嘗試了用BSA等其他蛋白質包被暴露的金顆粒表面，以確保金顆粒與IgG或Fab, 片段之間l：l連接，但由此也導致標記探針過大，加之常用的膠體金顆粒為5～20nm，本身直徑較大，所以包被后的金顆粒抗體滲透性較差，導致敏感性下降。

另外，膠體金標記的抗體容易凝集形成絮狀物，雖在標記過程中經離心純化，但仍難免殘留一些凝集物，影響標記抗體的染色效果。此外，膠體金與IgG之間是通過物理吸附連接，而非化學鍵結合，故兩者易分離，游離的抗體可與標記抗體競爭，降低免疫染色陽性率。
 
    盡管如此，包埋后膠體金標記抗體免疫電鏡技術在研究GABA、*等氨基酸遞質在神經系統的超微結構定位和功能中亦發揮了重要作用，但因許多神經肽、酶和受體蛋白等經樹脂包埋和高溫聚合后。免疫反應性明顯減弱，膠體金標記抗體法往往不易顯示，使其應用受到一定限制。為彌補上述不足，Hainfield和Furuya于1992年建立了一種新的金標抗體法，其金顆粒直徑僅為1．4nm左右，故稱之為納米金(nanogold)。