確定有無凋亡可用Annexin v-PI 雙染，因為該方法對早期凋亡比較敏感，如果沒測出明顯的凋亡，換別的也可能測不出。
用Annexin v-PI 雙染測出凋亡后，可根據標本或樣品情況選擇其它的方法來驗證，但我認為這并不是必須的，很多高質量的paper也只用一種方法測凋亡。當然你也要根據你下一步的實驗需要，如果你想進一步確定該凋亡是線粒體途徑還是死亡受體途徑，你可以檢測相應的caspase或選擇線粒體途徑的試劑盒等等。
zui簡單的是形態學的檢測，Hoechst染色，用熒光顯微鏡觀察，很便宜，200多塊買的染料，做到死也用不完，加上如果你的凋亡形態好，出的圖像也漂亮，周期也短，很直接就可以看到結果。還有大家都選擇的是DNAladder，步驟是很簡單，不過要想真的做出漂亮的LADDER可能還需要下不少的功夫，還有一種是流式細胞來檢測，也不算貴，這三種應該都是用的非常多的。
細胞凋亡過程中細胞核染色質的形態學改變分為三期：
Ⅰ期的細胞核呈波紋狀（rippled）或呈折縫樣（creased），部分染色質出現濃縮狀態；
Ⅱa期細胞核的染色質高度凝聚、邊緣化；
Ⅱb期的細胞核裂解為碎塊，產生凋亡小體
正常細胞和早、中期調亡細胞均可被Hoechst著色。
正常細胞核的Hoechst著色的形態呈圓形，淡蘭色，內有較深的藍色顆粒；
調亡細胞核由于濃集而呈亮蘭色，或核呈分葉，碎片狀。