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real-time PCR實驗檢測
產(chǎn)品特點:
Real-Time PCR 技術(shù),又稱實時定量熒光PCR,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,zui后通過標準曲線對未知模板進行總量分析或通過Ct值對模板進行相對定量。
熒光定量PCR實驗步驟:
1、總RNA抽提(槍頭和離心管均經(jīng)過濕熱滅菌,無RNA酶)
1)取勻漿器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上預冷。
2)取100mg組織,加入到勻漿器中。
3)充分研磨直至無可見組織塊。
4)13000g離心10min取上清。
5)加入250 μl,顛倒離心管15s,充分混勻,靜置3min。
6)4℃下13000g離心8min。
7)將上清轉(zhuǎn)移到一新的離心管中,加入0.8倍體積的異丙醇,顛倒混勻。
8)-20℃放置15min。
9)4℃下13000g離心10min,管底的白色沉淀即為RNA。
10)吸除液體,加入75%乙醇1.5ml洗滌沉淀。
11)4℃下13000g離心5min。
12)將液體吸除干凈,將離心管置于超凈臺上吹3min。
13)加入20μl無RNA酶的水溶解RNA。
14)55℃孵育5min。
real-time PCR實驗檢測
定量PCR:
1)取0.2ml PCR管,配制如下反應體系,每個反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物配制3管。
2× qPCR Mix 12.5μl
7.5μM基因引物 2.0μl
反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 2.5μl
ddH2O 8.0μl
2)取0.2ml PCR管,配制如下反應體系,每個反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物配制3管。
2×qPCR Mix 12.5μl
7.5μM內(nèi)參引物 2.0μl
反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 2.5μl
ddH2O 8.0μl
3)PCR擴增
預變性 95℃,10min
循環(huán)(40次) 95℃,15s→60℃,60s
溶解曲線 75℃→95℃,每20s升溫1℃
注意事項:
1、長度:15—30bp。
2、G十c含量:應在40%一60%之間。
3、堿基分布的隨機性
4、引物自身:不要含有自身互補序列,否則會形成發(fā)夾樣二級結(jié)構(gòu)。
5、引物之間:兩個引物之間不應有多于4個的互補或同源堿基,不然會形成引物二聚體,尤應避免3’端的互補重疊。
6、上下游引物的互補性:一個引物的3‘末端序列不允許結(jié)合到另一個引物的任何位點上。
7、3’末端:如果可能的話,每個引物的3‘末端堿基應為G或C。
8、設(shè)計RT-PCR的引物時,上下游引物要跨內(nèi)含子,以消除基因組DNA的干擾。
9、引物設(shè)計好后再NCBI上進行序列比對,檢查是否可能有錯配產(chǎn)物擴增。
10、引物設(shè)計要注意種屬。
real-time PCR實驗檢測
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