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ELISA的基礎是抗原或抗體的固相化及抗原或抗體的酶標記。結合在固相載體表面的抗原或抗體仍保持其免疫學活性，酶標記的抗原或抗體既保留其免疫學活性，又保留酶的活性。
elisa試劑盒抗體一般不能用于免疫組化的，雖然說理論上這兩個都是屬于免疫反應實驗，但是實際操作上還是有區別的。
首先，ELISA的抗體一般是針對抗原蛋白的三極結構的，所以操作一般在室溫下進行，避免高溫。
而免疫組織化學的抗體是針對抗原的一級結構的，所以要進行抗原熱修復。如果相互混用，很可能不能出結果。
抗體的標記并不一樣，ELISA的抗體一般是Streptavidin-HRP標記，免疫組織化學的抗原抗體結合后，還須SP、SABC將顯色反應放大，才能在顯微鏡下觀察。
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