基因組測序證實,慢性肝炎感染和炎癥可能對肝臟腫瘤中發(fā)現(xiàn)的基因突變,產生深遠的影響,從而為更好理解慢性肝炎導致癌癥的機制,鋪平了道路。
原發(fā)性肝癌是*癌癥死亡的第三大原因,zui近的研究表明,特別是在亞洲,感染乙型或丙型肝炎病毒,往往與這類癌癥有關。肝癌從細胞來源角度可分為三種:肝細胞型、膽管細胞型和混合型。
在這項研究中,研究小組對30份被歸類為有膽管表型的肝癌腫瘤樣本,進行了全基因組測序。這種類型的癌癥起源于肝臟,但是卻不同于肝細胞癌——原發(fā)性肝癌的主要形式,通常更具有侵襲性,預后較差。他們將數據與60個更為常見的肝細胞癌腫瘤進行了對比。為了研究基因表達,隨后他們檢測了來自25份膽管型肝癌和44份肝細胞癌樣本的RNA測序數據。
肝細胞癌和膽管表型肝癌之間是不同的,并取決于組織學類型,但是細胞中的總體突變模式,在感染丙型或乙型肝炎病毒的患者所顯現(xiàn)的腫瘤之間實際上是相似的,不同于沒有這種感染的患者腫瘤。這種相同的聚類,在病因學充分理解的癌癥中也曾發(fā)現(xiàn),癌癥——甚至不同組織學類型的癌癥,可能來自于相同的細胞,也許是肝臟祖細胞。在沒有感染肝炎的患者當中,我們沒有發(fā)現(xiàn)任何聚類,這表明他們的癌癥可能具有非常不同的細胞來源。
通過分析,研究人員還能夠確定更具侵襲性的膽管型肝癌相關的突變變化。具體地說,他們發(fā)現(xiàn),KRAS和IDHs(與更具侵襲性癌癥有關的基因)突變,在具有慢性肝炎的患者腫瘤中不太常見。
通過我們的分析,我們能夠鑒定一些具有膽管表型的肝癌,它們接近于肝癌,以及其他類似于膽管癌的癌癥。我們希望,在未來這將使我們能夠為每種類型的癌癥定制個性*法。我們也希望,我們所發(fā)現(xiàn)的新基因突變,可以用作未來治療的靶標。
這項研究是癌癥基因組協(xié)會(ICGC)項目的一部分,該項目旨在對50多種不同的腫瘤類型或/和亞型的基因組、轉錄組和表觀基因組變化,進行一個全面的描述,這在具有重要的臨床和社會意義。RIKEN負責其中一個項目,研究與病毒感染有關的肝癌。
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