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技術文章

轉移性癌癥患者有望從液體活檢中受益

點擊次數:250 發布時間:2017-11-17

通過檢測血液中的游離DNA(cfDNA),究竟能否提供癌癥的線索,這個問題困擾了人們很久。近日,Broad研究所的研究人員在《Nature Communications》上發表文章稱,90%的腫瘤遺傳特征可通過血液樣本的全外顯子組測序檢測到,這種方法可應用在近半的晚期癌癥患者身上。  通訊作者之一、Broad研究所的Viktor Adalsteinsson博士表示:“我們的zui終目標是利用血液活檢來全面搜索和鑒定哪怕是zui小的腫瘤殘留。隨著腫瘤進展到晚期,形成耐藥性或成為轉移瘤,我們希望在關鍵的時間點介入,決定哪種療法患者。”  

對癌癥患者而言,侵入性的手術活檢是痛苦且困難的,而且有些腫瘤的位置很難觸及。如今,液體活檢正成為一種新興的替代方法。通過檢測和分析患者血液樣本中的癌癥DNA,它有望克服傳統活檢的問題,讓醫生可實時追蹤疾病進展和治療情況,并幫助研究人員了解腫瘤的耐藥性如何形成。

收集DNA片段的全外顯子組,需要血液樣本中至少有10%的腫瘤DNA,但這個比例因患者而異。基于此,研究人員首先需要一種無偏倚的方法來測定癌癥DNA的水平,然后再開展測序。目前的許多血液活檢方法是篩查已知的癌癥相關基因,但這種靶向重測序方法可能會漏掉一些癌癥。  

在這項研究中,研究人員開發出一種稱為ichorCNA的工具,它能夠分析癌癥基因組中普遍存在的各種突變模式,捕獲帶有已知和未知突變的癌癥。此外,他們重點檢測了癌細胞中拷貝數過高或過低的DNA片段。總共有1439個血液樣本被檢測,它們來自520名轉移性乳腺癌或前列腺癌患者。  利用這種方法,研究人員發現在33%到49%的轉移性癌癥患者中,腫瘤DNA的含量超過了游離DNA的10%。這意味著游離DNA的全外顯子組測序是可行的。“我們的研究已經證明,我們能夠從血液中可靠地獲得癌癥外顯子組。它與腫瘤活檢相匹配,對相當一部分轉移性癌癥患者有用,”Adalsteinsson博士指出。  之后,研究人員對41名患者開展進一步分析,將腫瘤活檢結果與游離DNA的外顯子測序數據相比較。他們發現,外顯子組測序和組織活檢的遺傳數據在很大程度上匹配,比如體細胞突變的匹配度達88%,拷貝數改變的匹配度達80%。這些結果表明,游離DNA的全外顯子組測序有望替代許多患者的轉移性腫瘤活檢。  

總的來說,這項新的研究改進了血液活檢的分析流程,使其能夠在更大范圍內開展。研究人員正在積極地將這項成果應用在數千名轉移性癌癥患者上。“這項技術讓我們能夠追蹤癌癥的動態變化,了解耐藥性的演化以及轉移性狀態的發展,這是手術活檢無法實現的,”Broad研究所的Gad Getz談道。

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