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江蘇綠葉生物科技有限公司

在三維水平研究細胞的新工具

時間:2014-12-5閱讀:261
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開發了一種軟件,研究人員利用這種軟件,能夠比以往更詳細地研究病毒、細菌和人體組件。

檢驗cellPACK

cellPACK軟件解決了結構生物學的一個主要問題。雖然科學家們已經開發出了一些技術,來研究相對較大的結構(例如細胞)和非常小的結構(例如蛋白質),但它一直難以在中等的“中尺度”范圍內可視化這些結構。

上海隆壘研究人員可以迅速有效地處理他們所收集的較小結構的數據,并在這種中等尺度范圍內裝配模型。以前,研究人員必須手工創建這些模型,這需要數周或數月的時間,而使用cellPACK則只需要幾小時。

作為該軟件能力的一個示范,這項新研究的作者創建了一種HIV模型,展示了外部“刺突(spike)”蛋白在不成熟病毒表面是如何分布的。

這種新模型檢驗了HIV研究人員通過超分辨率顯微鏡研究得出的一個結論:spike蛋白在不成熟病毒表面是隨機分布的。但是,通過使用cellPACK生成數千個模型,檢驗替代假設.一個團隊的努力

上海隆壘研究員繼續從事這個項目。一種容易的方法來可視化中尺度結構。cellPACKJohnsonautoPACK軟件的一個擴展,這個軟件可標出材料的密度,從一個建筑物的混凝土到動脈中的紅血細胞。

隨著cellPACK的產生,成功解決了將不同來源和多尺度數據整合到虛擬模型(可以模擬細胞內生物相關的分子相互作用)的挑戰。這種用戶界面友好的工具,為以實驗室之間合作的方式進行數據分析和模擬,提供了一種新的平臺。

研究人員將改進這種軟件,使其能模擬新的形狀。 使其成為開放資源,會使這種工具更為強大。現在軟件是可用的,而且非常有用,具有具有完善的實驗技術開發平臺,成熟的抗原、抗體研發系統,熟練掌握各種酶聯技術,結合公司的研發團隊,可以有效的保證公司產品強的穩定性和高的準確性,同時又具有zui有競爭力的價格。

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