DNA是所有生物體的基本組成物質。真核生物DNA主要存在于細胞核中。制備DNA時應將細胞核膜打破方能釋放出來。

    細胞中的DNA和RNA分別與蛋白質相結合，形成脫氧核糖核蛋白及核糖核蛋白。在細胞破碎后，這兩種核蛋白將混雜在一起。因此，要制備DNA首先要將這兩種核蛋白分開。已知這兩種核蛋白在不同濃度的鹽溶液中具有不同的溶解度，如在0.15mol/L NaC1的稀鹽溶液中核糖核蛋白的溶解度zui大，脫氧核糖核蛋白的溶解度則zui小（僅約為在純水中的1%）；而在l mol/L NaCl的濃鹽溶液中，脫氧核糖核蛋白的溶解度增大，至少是在純水中的2倍，核糖核蛋白的溶解度則明顯降低。根據這種特性，調整鹽濃度即可把這兩種核蛋白分開。因此，在細胞破碎后，用稀鹽溶液，反復清洗，所得沉淀即為脫氧核糖核蛋白成分。

    分離得到的脫氧核糖核蛋白，用十二烷基硫酸鈉（SDS）使蛋白質成分變性，讓DNA游離出來，再用含有異戊醇的氯仿沉淀除去變性蛋白質。zui后根據核酸只溶于水而不溶于有機溶劑的特點，加入95%的乙醇即可從除去蛋白質的溶液中把DNA沉淀出來，獲得產品。

    當細胞破碎時，細胞內的脫氧核糖核酸酶（DNase）立即開始降解DNA，如果在破碎細胞后不及時采取抑制酶活的措施，zui后將會得不到任何DNA。為此，如在本實驗中加入檸檬酸鹽、EDTA等螯合劑以除DNase必需的Mg2＋離子，使DNase活性降低，并要求整個分離制備的過程均在4℃以下進行，以減少DNase的降解作用，zui后加入SDS使所有的蛋白質（包括DNase）變性。當然如果希望獲得更大分子的DNA時，則在細胞破碎后，及時加入SDS使蛋白質（包括DNase）變性，并加入蛋白酶K，降解所有的蛋白質成為碎片或氨基酸，及時阻止DNase的降解作用。

    DNA分子很大、很長，在水中呈黏稠狀，但DNA鏈的雙螺旋結構不宜小角度的折疊，使之DNA分子具有剛性，即分子是僵直的（stiff），小角度的折疊和壓擠等剪切力，將使DNA斷裂成碎片。為保證獲得大分子DNA，操作時應避免急裂振搖，或過大的離心力。轉移吸取DNA時不可用過細的吸頭，不可猛吸猛放，更不能用細的吸頭反復吹吸。

    大分子DNA的水溶液呈黏稠狀，可以用玻璃棒纏起來。液體DNA只要防止DNase污染和高鹽濃度條件下能在液體狀態保存；抽干后的固體DNA，性質穩定，可長期保存。

    生物體內各部位的DNA是相同的，但取材時以含量豐富的部位為主，如動物的肝臟、脾、腎、血液、精子等。所有材料，必須新鮮及時使用，或放入－20℃冰箱或液氮冷凍保存。DNA的含量及純度可用紫外吸收法、定磷法及化學法等測定。