中國農科院作科所供圖

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太谷核不育小麥是我國科技人員高忠麗于 1972 年在山西太谷發現的一個顯性核不育小麥材料，是由單顯性核基因控制的自然突變體，其特點是雄性敗育穩定*，不受環境條件影響，異交結實率高。它是進行小麥輪回選擇的理想材料。

中國農業科學院作物科學研究所（以下簡稱作科所）自上世紀就開始了對太谷核不育材料的研究，且碩果頻出。作科所研究員劉秉華通過雜交構建了矮稈基因和太谷核不育基因緊密連鎖的矮敗小麥，該材料的利用大大提高了小麥育種效率。

作科所研究員賈繼增、孔秀英研究團隊對該基因的克隆工作已開展了近 20 年，近期在克隆與解析小麥太谷核不育基因 Ms2 方面獲得突破性進展。今年 4 月 24 日，孔秀英在第 13 屆小麥遺傳大會上應邀作了大會報告，公開報道了該基因。相關研究論文已于近期在 Nature Communications 發表。文章以作科所為*完成單位，作科所夏川、張立超、鄒棖為共同*作者，孔秀英和賈繼增為共同通訊作者。山東農業大學付道林課題組也克隆了該基因并在同一雜志發表。

太谷核不育基因 Ms2 的克隆存在 3 個巨大的挑戰：一是 Ms2 所在的 4D 染色體是小麥 21 條染色體中多態性zui低的一條染色體；二是矮敗小麥中 Ms2 基因所在區段重組率非常低；三是 2012 年之前無小麥參考基因組序列發表。矮敗小麥是一個理想的輪回選擇育種材料，但該材料不適合用于 Ms2 基因的圖位克隆。研究團隊zui初選擇了用矮敗小麥構建圖位克隆的群體，本想“一箭雙雕”。然而當染色體步移到一定程度時，發現再也無法繼續前進。

進一步研究才發現，這是由于矮稈基因所在基因組片段是一個 1Mb 以上的串聯重復，導致該區段的重組被嚴重抑制。為了增加 4DS 染色體的多態性及提高太谷不育基因區段的重組率，研究人員又用正常株高的太谷核不育材料與多樣性高的人工合成小麥 Am3 雜交，重新配制分離群體，解決了重組問題與多樣性低的問題。為了解決參照基因組的問題，他們繪制了小麥 D 基因組的框架圖，使得小麥太谷核不育基因克隆的速度得以大幅度提升，zui終成功地克隆了 Ms2 基因。

研究發現，該基因沒有保守的功能結構域，是僅存在于小麥族物種中的“孤兒”基因；Ms2 的產生經歷了一個比較復雜的進化過程；一個新的非自主型的 TRIM 反轉錄轉座子插入到 Ms2 基因的啟動子區，激活了該基因并使其在花藥中特異表達，導致不育表型的產生；Ms2-TRIM 插入只影響基因的表達，這與該團隊以前在矮稈基因 Rht3 中鑒定的 CAAS-TRIM 插入引起基因結構改變不同，表明 TRIM 插入到基因附近增加了基因新功能和表型的可塑性；D 基因組的 Ms2-TRIM 可能來自 B 基因組的 5BL；該研究結果表明小麥多倍體化和富含轉座子的特點為產生新的表型提供了豐富的遺傳變異基礎。