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基于 BLAST 和 NJ 樹的分析,單片段與組合片段在種水平和屬水平的鑒定能力統計(A: n ≥ 1; B: n ≥ 2)
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樟科植物作為常見的重要經濟林木,在林業、輕工、醫藥等領域都占有重要的地位,大多數種類集中分布于長江以南各省區,然而對其物種的把握與識別卻始終是困擾大家的一個難題,阻礙了對其實施有效的生物多樣性保護與開發利用。物種的準確鑒定是一切生產、應用與研究至關重要的*步,DNA 條形碼技術的應用,使得前述難題都有方法可循。
為了探尋與評估 DNA 條形碼技術對這一難題的解決能力,中國科學院西雙版納熱帶植物園植物系統發育與保護研究組研究員李捷指導的博士研究生劉志芳和慈秀芹利用該研究組在樟科植物分類與系統學方面近二十年的研究與積累,將 DNA 條形碼技術與樟科形態學特征相結合,分別從條形碼的鑒定能力、物種糾錯能力和系統演化等三個方面進行了分析與探討。研究發現,條形碼組織的核心條形碼 matK 和 rbcL 與補充條形碼 trnH-psbA、ITS 和 ITS2,除對基部的部分類群有好的鑒定表現外,整體上對樟科植物的物種鑒定能力較弱;但是條形碼 ITS,如果不考慮序列的擴增與測序困難問題,其鑒定能力較佳,作為樟科植物的有力條形碼;條形碼技術與形態鑒定相結合,對樟科物種鑒定糾錯率高達 10.8%;條形碼數據可以一定程度地重建樟科植物的系統演化。此項研究對林業、輕工、醫藥領域利用樟科植物資源具有較高的參考價值,對樟科植物的分類與系統發育研究以及種質資源保護也有重要的意義,同時該研究也為正在開展的東南亞等地區樟科植物調查提供了數據參考。
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