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上海遠研生物科技有限公司

中國科學家完成世界*鯉魚基因組圖譜繪制

時間:2014-10-9閱讀:335
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中國水產科學研究院黑龍江水產研究所8日對外發布,由該院孫效文研究員的合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪制,并揭示其*的全基因組復制事件,這是上*完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果近日發表于《自然-遺傳》(Nature Genetics)雜志。

鯉魚是分布和養殖范圍zui廣泛的經濟魚類之一,是中國具有代表性的淡水養殖魚類,是zui有條件利用基因組資源進行品種改良的水產養殖物種。鯉魚基因組由100條染色體組成,是迄今完成全基因組測序的脊椎動物中染色體數目zui多的物種。


該研究團隊完成了雌核發育鯉魚的基因組深度測序、精細圖譜繪制和基因組注釋,其基因組由16.9億堿基組成,含有52610個功能基因,約為多數硬骨魚類基因數目的兩倍。研究團隊從基因組尺度證實了鯉魚基因組的異源四倍體特征及其*的全基因組復制事件,分子鐘證據表明鯉魚基因組四倍化大約發生在820萬年前,是迄今在脊椎動物中發現的zui近的全基因組倍增事件。研究團隊還開展了10個代表性品系(種群)33尾鯉魚的基因組重測序研究,繪制了鯉魚的單堿基分辨率基因組遺傳變異圖譜。此外,通過全基因組多態性掃描和比較轉錄組分析等手段,識別和定位了鯉魚鱗被缺失、體色決定等性狀相關的遺傳位點、功能基因和調控通路。

鯉魚全基因組序列圖譜的完成,標志著鯉科魚類重要經濟性狀的遺傳解析和遺傳選育研究全面進入基因組時代。對于解析鯉科魚類生長、品質、抗病、抗逆等重要經濟性狀的分子機制具有重要意義,同時也為研究脊椎動物基因組進化和基因衍化機制提供了寶貴的數據和模型,為開展全基因組選擇育種,培育品質優良的鯉魚新品種奠定了堅實基礎,具有重要的理論意義和應用價值。

來源:中新社

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