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上海滬宇生物科技有限公司
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閱讀:315發布時間:2015-8-18
研究介紹了再生障礙性貧血的突變和克隆動態模式。這是由多種原因引起的造血障礙,有時會發展成骨髓增生異常綜合征或急性髓系白血病。
研究小組綜合利用外顯子組測序、靶向測序和基于芯片的核型分析,研究了400多名患者血液樣本的體細胞突變圖譜。通過這些數據,研究人員在近一半的樣本中發現造血細胞克隆的擴增。在約三分之一的病例中,他們檢測到與骨髓增生異常綜合征和/或AML相關的基因突變。
骨髓移植和免疫抑制療法已經成功治療甚至*了許多再生障礙性貧血的病例。然而,大約有15%的患者仍然會發展成骨髓增生異常綜合征或急性髓系白血病,這個過程似乎涉及到某些含有突變的克隆的進化和擴增。此外,一些含有體細胞突變的造血干細胞克隆的擴增也會導致其他疾病,如陣發性睡眠性血紅蛋白尿癥。
為了區分開這些不同疾病的克隆特征,研究人員利用測序來評估668個血液樣本中存在的突變,這些樣本來自439名再生障礙性貧血患者。研究人員對所有樣本開展靶向基因測序,重點關注106個之前與髓系腫瘤相關的基因,其平均覆蓋度達到1248倍。
利用測序的數據,他們發現156名患者存在體細胞突變,其中56名患者攜帶兩個或更多的基因突變。超過四分之三的突變落入少數基因中,如BCOR、BCPRL1、PIGA、DNMT3A、和ASXL1。此外,超過10%病例的6號染色體出現小問題,與陣發性睡眠性血紅蛋白尿癥存在關聯。
之后,研究人員對52名患者的135個樣本進行了外顯子組測序,平均覆蓋度達到112倍。他們在25個病例中發現了體細胞突變事件。
結果表明,再生障礙性貧血的發展往往伴隨著一些克隆的減少或維持,以及另一些克隆的擴增。前者包括含有BCOR、BCORL1或PIGA突變的克隆,而后者的特點是含有DNMT3A和/或ASXL1突變。
DNMT3A、ASXL1和RUNX1中突變的存在與無進展生存期和總生存時間較短相關。相比之下,BCOR和BCORL1的突變則對應了免疫抑制療法的良好預后。
不過,研究人員也指出,克隆動態似乎變化很大,這讓預后難以判斷。此外,隨著年齡增長,血細胞逐漸積累突變,這似乎讓預測進一步復雜化。“通過深度測序和SNP芯片核型分析密切監控克隆,并結合臨床評估,才能判斷預后并指導治療,"他們總結道。
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