細(xì)胞凋亡過程中可觀察到系列形態(tài)學(xué)特征和生化特征。早期凋亡信號的效應(yīng)產(chǎn)生于胞內(nèi)，此時細(xì)胞膜保持完整。現(xiàn)已發(fā)展出幾種方法以檢測凋亡細(xì)胞胞內(nèi)的多種效應(yīng)，包括：DNA *段的檢測、膜對稱性的變化、caspases 激活、以及細(xì)胞死亡相關(guān)蛋白水平的變化等。多數(shù)檢測使用的底物和Marker 適用于絕大多數(shù)種類的哺乳動物。
凋亡細(xì)胞染色體DNA 以核小體為單位的切割導(dǎo)致細(xì)胞不可逆死亡。可以采用Nucleosome ELISA，對產(chǎn)生的單體及寡聚核DNA *段進行定量。核小體的DNA 成分被捕獲于酶標(biāo)板上，使用*標(biāo)記的抗組蛋白抗體檢測捕獲的核小體數(shù)量。組蛋白-DNA *段的量反應(yīng)了一個特定樣品中死亡及瀕臨死亡的細(xì)胞的量。
DNA *段也可通過片段末端標(biāo)記進行原位檢測，DNA *段末端標(biāo)記可通過熒光染料或比色底物方法進行檢測。另外，細(xì)胞形態(tài)的變化如胞膜皺摺或出泡、核染色質(zhì)致密、胞質(zhì)濃縮等，都可作為細(xì)胞凋亡的證據(jù)。采用熒光染料進行末端標(biāo)記的可用流式細(xì)胞技術(shù)進行定量，其光散射變化也可支持由單一參數(shù)得出的結(jié)論。DNA *段可以從凋亡細(xì)胞中分離（Suicide TrackTM DNA ladder Isolation Kit, ）并使用瓊脂糖電泳進行分析。約180bp 的多倍寡核小體片段在電泳上呈典型的梯狀條帶，可進一步證實凋亡的存在。若使用Pellet Paint Co-Precipitant，只需室溫操作，兩分鐘即幫助DNA 沉淀更快捷方便。
線粒體膜電位和膜通透性的變化也是凋亡細(xì)胞一個重要特點。可使用Cytochrome c ELISA Kit或Cytochrome c Release Apoptosis Assay Kit試劑盒檢測凋亡細(xì)胞線粒體所釋放的*。也可使用Cytosol/Mitochondria Fractionation Kit分離凋亡細(xì)胞線粒體，其膜電位可通過MitoCaptureTM Apoptosis Detection Kit檢測。凋亡細(xì)胞另一個生化特征是細(xì)胞膜內(nèi)側(cè)的磷脂酰*從胞質(zhì)轉(zhuǎn)至胞外。膜聯(lián)蛋白中的Annexin Ⅴ，是一種磷脂結(jié)合蛋白，與磷脂酰*有強親和力。通過使用Annexin Ⅴ-FITC或 Annexin Ⅴ-Biotin ,Apoptosis Detection Kit ，及RAPIDTM 方法進行凋亡細(xì)胞早期檢測。可使用流式細(xì)胞儀或熒光顯微鏡監(jiān)測。同時使用PI，根據(jù)細(xì)胞膜的通透性區(qū)分早期凋亡細(xì)胞和壞死細(xì)胞。
凋亡過程中細(xì)胞核同樣發(fā)生了結(jié)構(gòu)變化。接收到凋亡信號后，核基質(zhì)蛋白（NMPs）釋放。NMP 的釋放與細(xì)胞死亡相，MERCK 的Cell Death Detection（NMP） ELISA可定量檢測細(xì)胞培養(yǎng)上清中的NMP 水平變化。此種檢測方法優(yōu)于其它方法的原因在于可以直接檢測組織培養(yǎng)基中NMPs 的水平，而不需細(xì)胞總裂解物，從而避免了細(xì)胞計數(shù)和樣品準(zhǔn)備等操作。除了結(jié)構(gòu)變化，凋亡細(xì)胞*水平會降低，可通過Glutathione Apoptosis Assay Kit進行檢測。
凋亡可被系列環(huán)境危害、發(fā)育信號等誘導(dǎo)產(chǎn)生，免疫耐受的誘導(dǎo)和保持，涉及細(xì)胞表面受體的參與。Fas（APO-1, CD95） 是主要的死亡受體，在多種細(xì)胞中引發(fā)凋亡過程。Fas 配體（FasL/CD95L）與Fas 結(jié)合，激活的Fas 進而激活包含caspase 在內(nèi)的幾種效應(yīng)蛋白。FAS/APO-1 ELISA Kit可以檢測細(xì)胞抽提物、組織培養(yǎng)物、血清中Fas 的水平。同樣，F(xiàn)as Ligand ELISA 可定量檢測上述各種形式樣品中的膜結(jié)合FasL 和可溶性FasL。兩種檢測試劑盒都具有很好的靈敏度和度。另外兩種ELISA 試劑盒都提供96 孔板形式，適于高通量篩選。
Caspases 參與Fas 介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡的情況現(xiàn)已闡明。Caspase-8 和caspase-9 啟動效應(yīng)因子caspase-3 ，后者切割細(xì)胞內(nèi)含有特定識別序列的底物。針對caspases 的活性檢測，通過對特定底物的切割、釋放出熒光產(chǎn)物。同時提供陽性對照、陰性對照、特異的caspase 抑制劑以輔助解釋實驗結(jié)果。另外caspase-3 、caspase-8 和caspase-9 活性檢測試劑盒都提供高通量形式幫助篩選鑒定觸發(fā)細(xì)胞凋亡信號的因子。
