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單細(xì)胞分析為干細(xì)胞和癌癥研究帶來希望

閱讀:558發(fā)布時(shí)間:2014-8-21

 

單細(xì)胞基因表達(dá)的大規(guī)模分析,有可能發(fā)現(xiàn)罕見的細(xì)胞群和血統(tǒng)關(guān)系,但是需要有效的方法進(jìn)行細(xì)胞捕獲和mRNA測(cè)序。盡管細(xì)胞條形碼策略允許超低深度的單細(xì)胞平行測(cè)序,但是測(cè)序深度較淺的限制還沒有得到直接的研究。

研究小組使用的技術(shù),主要集中在一個(gè)“微流體”設(shè)備,在這個(gè)設(shè)備中單個(gè)細(xì)胞被捕獲并流入納米級(jí)的小室中,那里它們有效而地進(jìn)行DNA測(cè)序所必需的化學(xué)反應(yīng)。研究表明,確定和拼出*序列,并成功地確定細(xì)胞類型所需要的閱讀步驟數(shù)量,比原先估計(jì)的少100倍。這項(xiàng)技術(shù),是由Fluidigm公司開發(fā),可同時(shí)用于96個(gè)細(xì)胞的單獨(dú)過程。

Kriegstein稱,識(shí)別不同細(xì)胞類型的數(shù)百個(gè)新型生物標(biāo)志物,將提高科學(xué)家們對(duì)于出現(xiàn)特化神經(jīng)元亞型的理解。zui終,這種集中于單細(xì)胞基因活性的新方法,與其他單細(xì)胞技術(shù)(包括顯微成像)相結(jié)合,可能會(huì)揭示腦部發(fā)育障礙的起源。

Kriegstein指出,這個(gè)過程可以揭示一些腦部疾病,包括平腦癥,這種疾病患者大腦皮層中的褶皺無法發(fā)育,而且疾病在發(fā)育后期才被診斷,如自閉癥和精神分裂癥。

根據(jù)這篇論文的作者介紹,這種分析單細(xì)胞中分子的策略,不僅有利于研究特化細(xì)胞如何出現(xiàn)在發(fā)育有機(jī)體的特定時(shí)間和地點(diǎn),也有利于監(jiān)測(cè)干細(xì)胞(設(shè)計(jì)用于組織置換)的細(xì)胞特性,以及調(diào)查腫瘤內(nèi)細(xì)胞多樣性以確定癌細(xì)胞存活和傳播的原因。

任何未經(jīng)處理的生物樣品,無論多么純,其中都含有各種各樣代表不同組織類型的細(xì)胞。研究人員已經(jīng)測(cè)定了這些樣品中的結(jié)合遺傳物質(zhì)。為了研究哪些基因是活躍的,哪些是休眠的,他們使用測(cè)序步驟的無理性重復(fù),來捕捉足夠數(shù)量的信使RNA序列,這些序列轉(zhuǎn)錄自交換基因。然而,很難從混合組織樣品中推斷,哪些基因是由特定的細(xì)胞類型表達(dá)的。


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