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技術(shù)文章

一種用于測序非模式物種

閱讀:477發(fā)布時間:2014-2-17

 

上海滬宇生物科技有限公司是一家專業(yè)代理國內(nèi)外化學及生化試劑、分子生物學試劑盒、實驗儀器等產(chǎn)品,并實行一站式配套服務的企業(yè)。多年來公司堅持誠信至上、精誠服務的經(jīng)營宗旨,加強與各方的合作,憑借科學的管理方式,一絲不茍的工作作風,力爭以zui快的速度,向顧客提供zui的產(chǎn)品和zui周到的服務,在客戶中贏得了良好的聲譽。除深獲顧客信賴外,更帶給顧客喜悅和滿足,公司員工亦因此找到工作及生活的意義。潤捷人將緊跟經(jīng)營管理和科學技術(shù)發(fā)展的步伐,提升和加強公司的市場競爭力,同心協(xié)力,盡展創(chuàng)意,致力于可持續(xù)發(fā)展、向社會盡責的企業(yè)宗旨。

Chamala等人描述了一種針對具有大型以及復雜基因組的非模式物種的新的測序和組裝流水線策略。他們首先利用一種Illumina和Sanger公司的細菌人工染色體末端組合制造了一種全基因組。他們隨后利用原位雜交中的熒光反應評估了裝配的準確性,這是之前以這種方式未曾探索過的一種技術(shù)。

無油樟基因組研究團隊詮釋了無油樟科的核序列,并用它來分析被子植物的進化。結(jié)構(gòu)分析證實了被子植物共同祖先中的一個全基因組復制事件,還揭示了導致無油樟科的世系中并沒有更進一步的此類事件。這種核基因組因此可以作為在其他開花植物基因組中闡明進化的一個很好的參考。例如,作者能夠重建真雙子葉植物的祖先——預六倍體基因排列,構(gòu)成約75%的被子植物。

Rice等人得到了無油樟科的3.9Mb的線粒體基因組,這比許多細菌基因組都大。作為水平基因轉(zhuǎn)移的一個結(jié)果,它包含了從綠藻、苔蘚和其他被子植物獲得的6個線粒體基因組的等價物。水平基因轉(zhuǎn)移的這一規(guī)模包括4種之前未曾發(fā)現(xiàn)的全基因組轉(zhuǎn)移。隨著外來DNA中獲得如此大的延伸,并*來自綠色植物的線粒體,作者認為轉(zhuǎn)移發(fā)生在于捕獲整個線粒體,緊隨線粒體融合之后。

無油樟科的線粒體DNA被認為如此不同尋常,這是因為與大部分植物相比,無油樟科更多暴露在附生植物中,后者是一種在其他植物上生長的非寄生植物,并且由于它有一個傾向,能夠維持傷口和生產(chǎn)吸盤豆芽,這可能導致線粒體轉(zhuǎn)移。zui終,它具有一種異乎尋常低頻率的線粒體DNA損失。

這種新策略毫無疑問對于其他非模式物種而言也是有用的,并且無油樟科*的進化位置將提供許多開花植物進化的信息。而水平基因轉(zhuǎn)移也提出了許多關(guān)于線粒體基因轉(zhuǎn)移機制和線粒體融合進化的新問題。


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