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閱讀:292發布時間:2016-10-25
荷蘭一個研究小組對數千個de novo突變進行薈萃分析,鑒定出10個智力殘疾的候選基因,這些突變是從兩千多個患病家庭的外顯子組序列中鑒定出的。
在這項研究中,研究人員對820名患有輕度至重度智力殘疾的兒童及其父母進行外顯子組測序,隨后綜合了已發表研究中其他1,300個家庭的序列信息。當他們分析這些家庭中的2,637個de novo突變時,他們發現10個基因與智力殘疾相關。
研究小組以820名患病兒童及其父母為研究對象,利用安捷倫的SureSelect技術富集了基因組的蛋白編碼區域,并利用Illumina的HiSeq儀器進行測序。
在平均覆蓋深度達75倍的外顯子組中,研究人員發現了1,083個可疑的de novo突變,影響到915個基因。考慮到基因特異的突變率,他們發現18個已知的智力殘疾基因,似乎不成比例地受到de novo突變的影響。
為了梳理出新的候選基因,研究小組剔除了已知基因中含有突變的個體,并重復分析,將頻繁發生的de novo突變縮小到4個基因上:DLG4、PPM1D、SOX5和TCF20。此外,研究人員利用已發表研究中的數據,發現了另外6個候選基因。
在薈萃分析中,研究人員對1,471名個體中的1,235個基因進行分析,發現除了上面的4個基因之外,還有6個基因:RAC1、SMAD6、SON、TLK2、TRIP12和SYNCRIP,它們也包含許多功能喪失的de novo突變。
研究小組指出,一些基因中的de novo突變似乎產生了重疊的臨床特征,包括兩名兒童中TLK2基因的突變帶來了相似的面部畸形。新分析中受到de novo突變影響的許多基因或通路與其他疾病的關聯基因重疊,包括自閉癥譜系障礙或其他神經發育疾病。
研究強調了de novo突變對各種神經發育表型的影響,并指出“大量的罕見發育障礙基因仍有待確定”。
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