多數自身免疫病患者血清中都會出現自身抗體。雖然有些自身抗體在疾病中的確切意義尚未得到嚴格的證實，但其與疾病的相關性已得到認可，所以這些自身抗體在自身免疫病的診斷和療效評價方面都具有重要的意義。
一、抗核抗體
抗核抗體泛指抗各種核成分的抗體，是一種廣泛存在的自身抗體。ANA的性質主要是IgG，也有IgM和IgA，甚至IgD和IgE。ANA可以與不同來源的細胞核起反應，無器官特異性和種屬特異性。ANA主要存在于血清中，也可存在于其他體液如滑膜液、胸水和尿液中。
ANA在SIE患者的滴度較高，但也出現在其他許多自身免疫病中，在許多研究報告中，都將檢出ANA作為自身免疫甚至自身免疫病存在的依據。這種現象的機制尚未明了，有待于進一步研究。
（一）ANA的類型及意義
由于細胞核成分的復雜性，不同成分的抗原性也不同；因此就會有多種不同的ANA。
1．抗核蛋白抗體核蛋白抗原（DNP）由DNA和組蛋白組成。由于DNP抗原存在不溶性和可溶性兩個部分，可分別產生相應的抗體。不溶性DNP抗體通常不*被DNA和組蛋白所吸收，它是形成狼瘡細胞的因子；可溶性抗原存在于各種關節炎病人的滑膜液中，其相應抗體也出現于RA病人的滑膜液中。
2．抗DNA抗體可以分為兩大類：①抗天然DNA（nDNA）抗體，或稱抗雙鏈DNA（dsDNA）抗體；②抗變性DNA抗體，或稱抗單鏈DNA（ssDNA）抗體。抗dsDNA抗體對SLE有較高的特異性，70％～90％的活動期SLE病人該抗體陽性，效價較高，并與病情有關。抗ssDNA抗體可見于多種疾病中，特異性較差。
3．抗ENA抗體可提取性核抗原（ENA）多從動物的胸腺中提取。先將胸腺勻漿并破碎細胞，分離出細胞核；再經鹽水或磷酸鹽緩沖液處理后，很容易從胞核中提取出來。ENA不含DNA，對核糖核酸酶敏感。近年來的研究表明，ENA可分為十幾種，現僅介紹幾種主要的ENA及其相應抗體。
（1）抗PNP抗體：PNA即核糖核蛋白，對核糖核酸酶和*敏感，加熱561h變性。抗PNP抗體多見于混合性結締組織病。價的抗PNP抗體對混合性結締組織病有診斷意義，而低效價的抗PNP抗體可在SIE患者中發現。
（2）抗Sm抗體：該抗體在一名Smith姓的患者血中發現，便以其名字的前兩個字母命名。Sm抗原系非核酸性糖蛋白，對DNase及RNase均不敏感，但經碘酸鹽及*處理后可被水解。抗Sm抗體是SLE的特異性標志之一，但陽性率偏低，約為30％～4％；可能是SIE的一種回憶性抗體，故在非活動期亦可檢出。若將抗dsDNA和抗Sm抗體同時檢測，可提高SLE的診斷率。
（3）抗SS-A抗體：SS-A為干燥綜合征（SS）的A抗原，可從動物胸腺的胞漿中提取。抗SS-A抗體主要見于SS，但也可見于其他自身免疫病如SLE中。
（4）抗SS-B抗體：SS-B為SS的B抗原，亦可從動物胸腺或小鼠肝細胞漿中提取，可被*、輕度加熱或改變溶液pH而破壞。13％的SLE及30％的SS患者有抗SS-B抗體。
（5）抗組蛋白抗體（AHA）：組蛋白是一種堿性蛋白質，含有大量的賴氨酸及*。目前已經發現組蛋白抗原可分為5個亞單位：H-1、H2A、H-2B、H-3、H-4。抗組蛋白抗體及其抗亞單位抗體見于SLE及藥物誘發的LE。SLE病人血清中的抗組蛋白亞單位抗體檢出率順序為：抗H-2B、抗H-1、抗H-3、抗H-2A及抗H-4，以抗H-2B和抗H-1為主，并與SLE的活動性有關。
