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英研制出“U盤”基因組測序儀
英國牛津納米孔技術公司在佛羅里達州基因組生物學與技術會議上宣布了一個爆炸性消息,即推出GridION和MinION兩款基于新一代DNA測序技術的便攜式基因組測序儀,后者僅有U盤大小,可插入電腦USB端口完成測序,價格僅900美元。
兩個儀器都是基于納米孔測序技術,采用一種特殊的蛋白在薄膜結構上打出納米級小洞或小孔,在膜的一側施加電壓將單條DNA鏈(帶負電)拉進納米孔。當DNA的化學堿基通過時,引起細微的電流變化,測量這種變化即可識別出不同的堿基(T、C、G和A)組成順序,然后通過電腦將每一部分的結果編織在一起呈現。人類基因組包含大約30億個堿基,DNA測序就是將這些堿基的順序識讀出來。
該消息令投資者大為振奮,而對于牛津納米孔技術公司的競爭對手美國Illumina公司和生命科技公司來說猶如一記重創。生命科技公司于今年初推出的臺式離子質子序列發生器測序需要24小時,價格約15萬美元。相比之下,如果將20個單元連接在一起,GridION可在15分鐘內完成整個人類基因組測序,價格為5000美元;如U盤大小、即插即用的MinION可直接插入筆記本電腦USB端口測序。
無疑,新測序儀將帶來DNA測序更為廣泛的應用,允許非專業科學家提取DNA信息,即使在野外研究人員也可將樣品置于儀器中,將其插入載有相關軟件的筆記本電腦后,幾乎片刻就會得到基因組樣品的信息,以確定植物或動物的遺傳性狀。種子研究公司可使用它來分析田間作物,如查查是否有外源混合;肉類檢查員可拿它測試不同類型的微生物;生物學家可以用它來尋找幾代人基因中的微小變化。
然而,在這些愿景中也有小小瑕疵:目前這種設備有4%的錯誤率;MinION是一次性的,產量不如GridION高;盡管該公司稱,在今年某個時候發售相關產品之前,價格會大幅下降,但對于許多應用者來說還是有些貴。
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