旁流水處理器，利用特殊材料制成的金屬電極，在適當的外加電壓作用下，使流經的水產生微電解，使水中溶解的氯離子、氧分子及水分子產生以下氧化性物質：二氧化氯（CLO2）、活性氧（O）、雙氧水（H2O2）、分子氯（CL）、次氯酸（ClO）等。這些氧化性物質通過水的流動，擴散到所有水經過的地方，殺滅水系統中的細菌、藻類細胞。 流經水處理器的水中細菌、藻類細胞，因在電流作用下，被直接殺死，活性氧在管道上生成氧化膜，保護設備不被進一步腐蝕，各種微生物腐蝕、沉積腐蝕被抑制。
水經處理后，水分子聚合度降低，結構發生變化，水的偶極距增大，極性增加，所有這些變化，都增加了水的水合能力和溶垢能力。對于已結垢的系統，活性氧將破壞分子間的電子結合力，改變其晶體結構，使堅硬老垢變為疏松軟化，積垢逐漸溶解或成碎屑脫落。水中所含的鹽類離子Ca2+、Mg2+、CO32-、SO42-等因受到微電流的作用，分別趨向于不同的電極并被重新排列，難于趨向器壁積聚，從而防止水垢生成。
