在二次供水水處理行業中，主流消毒方法分別是指氯消毒、臭氧消毒、紫外線消毒器消毒以及水箱自潔消毒器消毒。水箱自潔消毒器、水箱消毒器、水箱自潔器、水箱水處理機消毒實際上是指對水箱水處理從而達到氧化和消毒目的的方法。

既然能夠位列四大主流消毒方法之一，在水處理中相對于紫外線消毒器等其他消毒方法水箱自潔消毒器消毒法自然也具有著顯著的優勢。首先采用水箱自潔消毒器、水箱消毒器、水箱自潔器、水箱水處理機消毒法可以有效避免游離性余氯過高時產生的臭味；其次相對于紫外線消毒器殺菌及其他化學方法還可以維持更長消毒時間，從而更有效地控制水中殘余細菌繁殖；更重要的是采用水箱自潔消毒器消毒還能夠有效減少消毒過程中THMs的產量。

所謂有利便有弊，采用水箱自潔消毒器、水箱消毒器、水箱自潔器、水箱水處理機消毒也有一定的缺陷。首先相對于紫外線消毒殺菌設備和二氧化氯等方法，水箱自潔消毒器只能針對二次供水水箱消毒，不宜單獨作為飲用水的消毒劑使用；其次，由于使用水箱自潔器較紫外線消毒器等消毒技術的操作較為復雜；另外水箱自潔消毒器消毒需要更長的接觸時間，而紫外線消毒器卻能瞬間殺菌。

綜上所述，作為zui常用消毒方法之一，水箱自潔消毒器、水箱消毒器、水箱自潔器、水箱水處理機消毒具有著一定的優勢，但是和包括紫外線消毒器殺菌在內的其他方法相比也存在著一定的劣勢。在水處理過程中只有綜合考慮水質及要求結合多種方法才能更有效的達到消毒殺菌效果。例如，水箱自潔消毒器、水箱消毒器、水箱自潔器、水箱水處理機結合氯進行消毒既可以保證消毒效果，又可以減少三鹵甲烷的產生，且可以在延長配水管網中的作用時間。