PPR 蛋白的 RNA 結合模式與已知的 RNA 結合蛋白均不同。 PPR 蛋白由多個 PPR 重復單元組成，大多數情況下，一個經典的 PPR 重復單元含有35個氨基酸，每一個重復單元可以特異性地識別一個 RNA 堿基，近兩年的生物信息學和初步生物化學研究研究顯示 PPR 模塊與 RNA 序列有特異的對應關系，但其識別機理及識別密碼尚不明確。揭示 PPR 蛋白特異識別 RNA 堿基的分子機制對于理解 PPR 蛋白的工作機理以及促進 PPR 蛋白生物技術領域的應用具有重要意義。{試劑酶聯網：www.shjgogo.com}   ELISA試劑盒相關產品推薦：

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顏寧教授研究組與施一公、朱健康、王佳偉、王宏偉等課題組合作，選擇源自玉米葉綠體的 PPR10 蛋白進行了深入的結構生物學和生物化學分析，zui終獲得了 PPR10 蛋白在未結合 RNA 和特異結合靶標PSAJ單鏈 RNA 兩種狀態下的高分辨率晶體結構。結構顯示， PPR10 包含19個 PPR 重復單元，每個 PPR 重復單元均為helix-loop-helix結構，多個重復單元組成兩圈右手超螺旋。 PPR10 -PSAJ的復合體晶體結構則清晰地揭示了 PPR 蛋白特異性識別 RNA 堿基的分子機理。特異識別發生于 PPR 重復單元的第2、5、35位的氨基酸與相對應的 RNA 堿基，這一結構生物學發現為破解 PPR 的 RNA 識別密碼提供了直接的依據。

自然界中有許多具有重復單元構造的蛋白質，其結構與功能的揭示往往可以把這些蛋白質改造為重要的工具蛋白。例如科學家根據 TALE 蛋白對 DNA 序列的特異識別，設計組裝能夠識別任意序列雙鏈 DNA 的 TALE N工具酶，進而對基因組進行改造。 TALE N已經在多個物種中獲得了廣泛應用。這是顏寧課題組與合作者繼 2012 年 1 月在《科學》報道 TALE 蛋白識別雙鏈 DNA 的分子機制后，對重復單元蛋白的又一項結構與功能研究，希望可以促進 PPR 在生物技術中的應用。

上海同步輻射光源（SSRF）何建華研究員及郁峰博士為數據收集提供了及時有效的幫助，保證了研究組在這一課題上取得突破。南開大學龍加福研究組為 PPR 蛋白的生化性質鑒定提供了重要支持。