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在美國zui主要的介水傳播的寄生蟲病是阿米巴病和賈第蟲病。看來阿米巴病的爆發是配水系統受污水污染的結果。近年來賈第蟲病成了某些地區的主要問題,看來與地面水處理不當有關。
這兩種寄生蟲的包囊對氯的抵抗力比細菌強,但通過混凝和過濾能將它們除去。可是對這些微生物經受消毒作用方面的知識現在還了解得不多。特別是如何殺滅賈第蟲病包囊的問題,尚需進一步研究。對少數其他幾種寄生的原生動物,也應同樣對待,這些原生動物雖然比較罕見,但在公用給水系統中也曾發現。
能在原水中生存的復細胞寄生蟲(蠕蟲和線形蟲),在公用給水系統中,可通過嚴格管理混凝、過濾和消毒過程加以控制。