大豆異黃酮具有雌性激素的性質，具有抗癌活性。如果大豆食品的抗癌效果的確是由于異黃酮的原因，那就賦予了大豆特別的重要性，標準物質大豆異黃酮的純化技術為了使其它非異黃酮成分分開，有小的使大豆異黃酮提物進一步分離純化。
傳統柱色譜法
硅膠柱及葡聚糖凝膠柱色譜在分離純化中藥有效成分中廣泛應用，它們同樣也可用于大豆異黃酮的分離純化。大豆異黃酮純化設備工藝在用聚酰胺柱層析時，用不同濃度的甲醇洗脫，可得到含量高達95%以上的大豆苷和染料木苷。
大孔吸附樹脂法
由于采用硅膠柱層析和葡聚糖凝膠柱層析時，多使用有毒性的有機溶劑且操作過程較為復雜，因此目前大多選擇大孔吸附樹脂柱層析來分離純化ISO，它具有選擇性好、解吸容易、無毒、無污染等優點。
高速逆流色譜法
高速逆流色譜法是一種不需固態載體的液液分配色譜技術，該技術與傳統方法比較具有分離效率高、操作簡便、可避免因不可逆吸附而引起的樣品損失等*的優點，因此已被廣泛應用于天然產物有效成分的分離制備當中。
膜分離技術是近年來迅速崛起的一項新技術，它作為一種新的分離純化和濃縮方法，具有耗能低、分離效率高、無二次污染、工藝簡單等優點。超濾技術將蛋白質等大分子物質截留，使ISO等低分子物質和鹽類隨水分子一起透過膜孔，結合滲濾技術后，使ISO的純度和收率提高，再通過反滲透技術將ISO濃縮，zui終ISO的回收率可以達到50%以上。
天然產物的提取方法正向著操作簡便、高效率、無污染的方向發展。大豆異黃酮提取、分離及純化提供了有力的手段。隨著現代新型技術的涌現，天然產物中的ISO成分將更進一步的被人們所認知并加以開發利 用。
