Thermo Scientific LTQ XL質譜與Ultimate 3000高速液相色譜系統聯用，是高通量分析的工具。結合多種解離技術，包括脈沖碰撞解離(PQD）和電子轉移解離(ETD），LTQ XL提供的結構信息。廣泛應用于蛋白質組學、代謝物鑒定、藥物研發定量分析、法醫和臨床分析等領域。
LTQ XL功能簡介：
1.可升級的電子轉移裂解（ETD)模塊可以提供傳統裂解方法無法得到的蛋白質翻譯后修飾信息；
2.脈沖碰撞能量誘導解離（PQD)功能可以提供低質量端碎片離子信息；
3.高選擇MS/MS分析給譜圖在數據庫和譜庫檢索更好的匹配，提高了結構確證的可靠性。另外快速極性切換，母離子相關MS3數據關聯掃描，可以對翻譯后修飾和代謝物組成的鑒定進行智能、快速分析，還可以和的回旋共振質譜組合成的多級高分辨雜交質譜儀；
4.自動數據依賴性多級質譜采集技術不僅為用戶提供預測代謝物（母離子列表）結構信息，也能提供未預測到的代謝物結構信息。此外使用自動固定中性丟失數據依賴性(CNL)掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetworksTM 和Mass Frontier分析軟件增強復雜基質中代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更簡便。
離子化技術：
* IonMax離子源：ESI(電噴霧電離），APCI(大氣壓化學電離）和APPI（大氣壓光電離）探頭都是基于革新的Ion Max離子源而設計。它具有超高性能，結構簡單以及無需工具就可進行ESI和APCI探頭更換的特點，探頭在x，y，z三個方向均可調節。無論對于低流速還是高流速，都可以優化位置獲得靈敏度。
* 滿足各種需要的離子源配置：ESI(電噴霧電離源），APCI(大氣壓化學電離源），APPI（大氣壓光電離源），納噴電離源（NSI)。
主要應用：
* 應對代謝物鑒定和確證，LTQ系列質譜可自動查找到所有可能的代謝物。
* 基于離子/離子化學的電子轉移解離(ETD)，LTQ XL離子阱是實現此技術的儀器。ETD與CID互為補充，提高蛋白序列覆蓋率；保護不穩定PTM翻譯后修飾基團，簡化數據分析；單次進樣自動啟動CID和ETD。
* 母離子智能選擇：自動數據依賴多級質譜采集技術不僅能為用戶提供預測代謝物（母離子列表）結構信息，也能提供提供未預測的代謝物結構信息。此外，使用自動固定中性丟失數據依賴性（CNL)掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetWorks和MassFrontier分析軟件增強復雜基質鐘代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更加簡便。
* 應對蛋白質組學和生物標記問題，ETD解離技術使LTQ XL成為蛋白質組學研究更強大的分析工具。
* LTQ和LTQ XL質譜均可配置ETD裂解源，ETD能夠為線性離子阱提供類似ECD（電子捕獲解離）的裂解碎片，在生成大量肽段碎片的同時，保護不穩定的PTM翻譯后修飾集團，例如磷酸化翻譯后修飾。ETD功能與賽默飛世爾線性離子阱的高離子儲存量相結合，是蛋白質和肽類分析的新型有效工具。
