PCR 實驗室分為四個區域（試劑配制區-樣品處理區-核酸擴增區-產物分析區），進入各工作區域必須嚴格按照單一方向進行，不同的工作區域使用不同的工作服（例如不同的顏色）。工作人員離開各工作區域時，不得將工作服帶出。如果使用熒光PCR儀，擴增室和產物分析室可以合并。
為避免交叉污染，進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向進行并有響應壓力要求。
PCR擴增實驗室設計建設要點：
  一、PCR實驗室有三個功能區
     1、試劑準備區   2、樣本制備區   3、擴增分析區
  二、PCR實驗室可分為兩個形式
     1、分散布置形式  2、集中布置形式 
  三、PCR實驗室建設目的
     1、控制防止污染。 2、防止影響檢測結果。
  四、PCR實驗室必須設置緩沖間
     1、緩沖間是阻隔空氣交換的重要措施。
     2、當集中布置的PCR實驗室設置了緩沖間，還有足夠的面積時，可以設置PCR專用走廊。
  五、PCR實驗室設置PCR專用走廊的作用
     PCR專用走廊的是將實驗室與其他區域分開，防止交叉污染。鑒于本次檢測，要求人員采
取三級防護，基本上比平時BSL-2實驗室防護多出一道（雙層防護）。所以，樣本制備間（BSL-2）

的緩沖間宜適當擴大，用于脫卸第二層（內層）、帽子、口罩和手套等防護用品之所。