根據《保健食品注冊管理辦法》的規定，食品負責確定承擔保健食品試驗、樣品檢驗和復核檢驗的檢驗機構。進口保健食品必須在CDC進行試驗，從2013年的保健食品注冊檢驗機構遴選后，其它認定的檢驗機構也可以為進口保健食品進行注冊檢驗。承擔樣品注冊檢驗的機構不能再承擔該樣品的復核檢驗。
檢測樣品：
多糖類：膳食纖維、香菇多醣、中藥多糖等。
功能性：單糖、低聚糖、多元醇糖等。
脂肪酸類：多不飽和脂肪酸、磷酯、等。
維生素類：、族、、等。
多肽類：谷光甘肽、免疫球蛋白等。
蛋白質類：蛋白粉、等。
自由基清除劑類：超氧化物岐化酶(SOD)、谷光甘酞過氧化酶等。
活性菌類：聚乳酸菌、雙岐桿菌等。
微量元素類：硒、鋅、鈣等。
其他類：二十八醇、植物甾醇、皂甙(苷)等。
檢測項目：
理化指標檢測：感官指標檢測、凈含量檢測、水分檢測、pH值檢測、灰分檢測、酒精度檢測、酸價檢測、過氧化值檢測、固形物檢測、粗多糖檢測等。
微生物指標檢測：菌落總數檢測、大腸菌群檢測、霉菌檢測、酵母菌檢測、致病菌檢測(沙門氏菌檢驗、、志賀氏菌)溶血性鏈球菌檢測、阪岐腸桿菌檢測、單增李斯特菌檢測、商業無菌檢測等。
衛生指標檢測：重金屬檢測(鉛、砷、汞、鎘、鉻)、苯并芘檢測、食品添加劑檢測、營養標簽檢測、真菌毒素檢測、獸藥殘留檢測、農藥殘留檢測、經口毒性試驗等。
成分含量檢測：營養成分檢測、功效成分檢測、保健成分檢測、污染物成分檢測等。
保健品是保健食品的通俗說法。GB16740-97《保健（功能）食品通用標準》第3.1條將保健食品定義為：“保健（功能）食品是食品的一個種類，具有一般食品的共性，能調節人體的機能，適用于特定人群食用，但不以治療疾病為目的。”所以在產品的宣傳上，也不能出現有效率、成功率等相關的詞語。保健食品的保健作用在當今的社會中，也正在逐步被廣大群眾所接受。
檢測標準：
GB 16740-2014 食品安全標準 保健食品
GB 28404-2012 食品安全標準 保健食品中α-亞麻酸、二十碳五烯酸、二十二碳五烯酸和二十二碳六烯酸的測定
GB 17405-1998 保健食品良好生產規范
GB/T 5009.217-2008 保健食品中12的測定
GB/T 5009.197-2003 保健食品中鹽酸硫胺素、鹽酸吡哆醇、、和的測定
GB/T 5009.171-2003 保健食品中超氧化物歧化酶(SOD)活性的測定
GB/T 22244-2008 保健食品中前花青素的測定
GB/T 23788-2009 保健食品中大豆異黃酮的測定
GB/T 22251-2008 保健食品中的測定
GB/T 22249-2008 保健食品中番茄紅素的測定
GB/T 5009.194-2003 保健食品中免疫球蛋白IgG的測定
GB/T 5009.170-2003 保健食品中褪黑素含量的測定
GB/T 22250-2008 保健食品中綠原酸的測定
GB/T 5009.196-2003 保健食品中肌醇的測定
GB/T 22246-2008 保健食品中的測定
GB/T 22252-2008 保健食品中的測定
GB/T 5009.195-2003 保健食品中吡啶甲酸鉻含量的測定
GB/T 22247-2008 保健食品中淫羊藿苷的測定
GB/T 22248-2008 保健食品中甘草酸的測定
GB/T 5009.193-2003 保健食品中脫氫表雄甾酮(DHEA)測定
GB/T 22245-2008 保健食品中異嗪皮啶的測定
SN/T 2210-2008 保健食品中六價鉻的測定
SN/T 4054-2014 出口保健食品中育亨賓、、、的測定
SN/T 3866-2014 出口保健食品中和大黃素的測定
SN/T 3865-2014 出口保健食品中番茄紅素的測定
SN/T 4052-2014 出口保健食品中荷葉堿的測定
SN/T 3864-2014 出口保健食品中、苯乙雙胍的測定
SN/T 4002-2014 出口保健食品中的測定
SN/T 3867-2014 出口保健食品中利莫那班的測定
SN/T 4051-2014 出口保健食品中奧利斯他的測定
DB64/T 1513-2017 保健食品中阿魏酸的測定
