Gelred核酸染料(10000X)-EB替代染料
由美國Biotium公司研發的GelRed和GelGreen 是兩種集高靈敏、低毒性和超穩定于一身的的熒光核酸染色試劑。其水溶染色劑通過美國安全認定,廢棄物可直接倒入下水道,而不會造成任何環境污染。
目前大多數商業化的核酸染料(凝膠染色試劑)總是在安全性、穩定性和靈敏性等方面不*令人滿意。例如,雖然 EB(溴化乙啶)作為目前使用泛的核酸凝膠染色試劑,能夠在多數應用中提供可以接受的靈敏度,但它是一種高誘變性的化學物質,對人體潛在危害非常大。而且EB染色后會產生較高的背景熒光信號(如圖1)。SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微堿性電泳緩沖溶液或預制凝膠中會快速降解,穩定性差導致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認為是較為安全的核酸染料 ,但它的染色效果還遠不及 SYBR Green I 。
常用的染色方法有預制凝膠染色(前染)和凝膠電泳后染色(后染),無論采用哪一種方法,GelRed 和 GelGreen,都能表現出的靈敏度。
為配合302/312 nm UV 凝膠成像系統而設計的 GelRed ,按照Biotium公司創新的試驗步驟(該試驗步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統的 TBE 緩沖溶液),在凝膠電泳后染色法中優于或者至少相當于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同, GelRed 在預制凝膠法中使用時仍然有的靈敏度,事實上GelRed 在檢測低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現出更高的靈敏度,尤其對小分子量的 DNA 檢測非常靈敏。
如果您使用 488 nm 激光器或者LED可見光激成像儀,GelGreen染料則是。 GelGreen 無論是在預制凝膠(前染)還是凝膠電泳后染色(后染)中都與 SYBR Green I 靈敏度相當,但不存在后者的不穩定性問題。
實際上, GelRed 和 GelGreen ,特別是 GelRed 非常穩定,可以長期在室溫下保存。當這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時甚至可以使用微波爐加熱,便于采用常規方法制備預制凝膠。而含有染料的預制凝膠可以成批制備,并長期保存以備用。更重要的是, GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green I 大大提高了安全性。 獨立的測試服務公司( Litron Laboratories, Inc. )進行的標準艾姆斯氏測試結果表明, 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠高于推薦用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )濃度下, GelGreen 沒有誘變性,而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學結構使其難以穿透細胞膜進入細胞,正是這一特性降低了染料的細胞毒性。如圖3。相反, SYBR Green I 廣泛地用于活細胞線粒體和核 DNA 染色,這正是由于它能快速的被細胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對紫外線導致的突變有強烈的增強作用( Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91(2001) ),因此它的高細胞膜透性使它在紫外環境觀察時成為凝膠染色的主要有害物質。
特性:
gelred 高靈敏度
GelRed 和 GelGreen 是目前市場中的凝膠核酸染料
gelred 穩定性
可以使用微波爐加熱,染料和預制凝膠可以在室溫下長期保存
gelred 更安全
艾姆斯氏試驗結果表明,該染料的誘變性遠小于溴化乙錠 ( EB ) 和SYBR 系列染料
gelred 廣泛的適應性
適用于預制凝膠法和凝膠電泳后染色法
gelred 染色過程簡單
與 EB 一樣,在預制膠和電泳過程中不必擔心染料降解;而電泳后染色過程也只需 30 分鐘且無需脫色或沖洗
gelred 對 DNA 和 RNA 的遷移影響極小
對核酸遷移的影響小于 SYBR Green I
gelred 與標準凝膠成像系統以及可見光激發的凝膠觀察裝置兼容
GelRed 可以的替代 EB,無需任何操作上的改變 ; GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料,操作方法*一樣。

