100立方玻璃鋼化糞池的尺寸為直徑3100mm，長度為13000mm，運作過程一般是過濾沉淀→厭氧發酵→固體物分解→糞液排放。主要分為三格和四格兩種，三格叫三級玻璃鋼化糞池，四格叫四級玻璃鋼化糞池。

1、污水先由進水口排到1格，在1格里比重較大的固體物及蟲卵等物沉淀下來，利用池水中的厭氧細菌開始初步的發酵分解，經1格處理過的污水可分為三層：糊狀糞皮、比較澄清的糞液、和固體狀的糞渣。

2、經過初步分解的糞液流入第2格，而漂浮在上面的糞皮和沉積在下面的糞渣則留在1格繼續發酵。在2格中，糞液繼續發酵分解，蟲卵繼續下沉，病原體逐漸消失，糞液得到進一步無害化，產生的糞皮和糞渣厚度比1格明顯減少。

3、流入3格的糞液一般已經腐熟，其中病菌和蟲卵已基本消滅。3格功能主要起暫時儲存沉淀已基本無害的糞液作用，經過再次沉淀的糞液通過排水管流入管網。