醫院污水處理，通常包括一級處理和二級處理。 一般地說，若處理后出水排入市政下水道，通常只進行一級處理；若處理后出水直接排入河道，則需進行一級處理和二級處理；對排放標準嚴的地區，為防止水體的富營養化，需進行除磷脫氮三級處理。對酸性廢水、洗相廢水、放射性污水等特殊的醫院污水，應進行嚴格的收集和處理。有些地區為緩解供水緊張的矛盾，已進行醫院污水的深度處理和循環利用。實際采用何種方式處理醫院污水，應綜合考慮污水的來源、污水的流向及當地的供水情況等多方面因素。另外，醫院污水處理一個非常重要的方面，就是必須進行消毒處理，以殺滅各種病原微生物。
醫院污水處理后排放去向分為排入自然水體和通過市政下水道排入城市污水處理廠兩類。醫院污水處理所用工藝必須確保處理出水達標，主要采用的三種工藝有：加強處理效果的一級處理、二級處理和簡易生化處理。根據醫院的規模、性質和處理污水排放去向，進行工藝選擇。根據中醫院分類，分為傳染病醫院和綜合醫院。
醫院污水水質類似于生活污水，但成份復雜。如消毒劑，來自化驗、檢驗、手術等各科室的重金屬、試劑，以及可能的放射性同位素等。作為醫院，其排放的污水中含有大量有毒化學物質和多種致病菌、病毒和寄生蟲卵。它們在環境中具有一定的適應能力，有的甚至在污水中存活時間較長，若未處理或處理不當即排入水體或用于灌溉，將會污染環境，影響人們的身體健康。所以我們必須選用醫院污水處理設備，把污水及時的處理掉。
醫院污水處理設備適用于醫院、住宅區、飯店、賓館、療養院、學校，礦山、工廠、車站、機場等人口密集場所的生活污水或與之類似的工業廢水的處理。
