臭氧發生器的時間根據型號、產臭量的不同有所不一。通常來說，臭氧發生器消毒時間保持在25—40分鐘為好。時間太短臭氧分子不能*揮發，達不到消毒目的。如果時間超過一個小時以上就容易有臭氧殘留，需要開窗通風兩個小時進行分子發散。
在使用臭氧發生器時，我們要注意以下事項：
1、臭氧濃度確保消毒作用：
只要確保和其它消毒滅菌劑一樣，只要到達足夠的劑量，作用必定時間才干到達消殺作用。例如當臭氧濃度為0.08～0.6ppm時，對空氣中細菌繁殖 體中的大腸桿菌作用30min，其平均殺滅率達84.60～99.9%，而空氣中臭氧濃度為0.34～0.85ppm時，作用10～30min，其殺滅率 可達99.47～99.97%。又如臭氧對空氣消毒時，如進步濃度為 0.72mg/L時，作用時間仍為10min，殺滅率可達99.99%。一般講臭氧的濃度愈高其滅菌作用愈好。
2、環境臭氧濃度不能過高：
臭氧除了對人類有益的一面外，同時它又是一種對環境污染的物質，我國環境空氣質量標準（GB3095-1996）中規則臭氧的濃度限值（1小時平 均）一級標準為0.12mg/m3;二級標準為0.16mg/m3;三級標準為0.20mg/m3。臭氧的工業衛生標準大多數地區高限值為 0.1ppm（0.20mg/m3）。因而使用臭氧消毒滅菌濃度不應過高，臭氧發生器的產值不是越高越好。例如：一般家庭用室內滅菌的臭氧發生器產值應在 200mg/h左右，高不要超過400mg/h。這樣，在臭氧滅菌作業30～60min后，室內殘余濃度低于果品家衛生標準要求。
