在實際工程中催化劑模塊的長、寬尺寸基本保持固定不變，高度則要根據SCR系統脫硝效率所需，由設計人員或催化劑供應商確定。又如在SCR反應過程中，由于催化劑的存在，促使煙氣中部分SO2被氧化成SO3，在氣體混合物中轉變成SO3的SO2物質的量與起始狀態物質的量之比，稱為轉化率，SO2/SO3轉化率也是SCR系統中的重要指標之一。SO2/SO3轉化率越高，說明催化劑的活性越好，所需要的催化劑量越少。但高塵布置的脫硝反應器SO2/SO3轉化率越高，則越易產生煙道、空氣預熱器甚至電除塵器被硫酸腐蝕的危險，因此SCR系統中應嚴格控制SO2/SO3轉化率。目前，國內要求的SCR系統催化劑對SO2向SO3的轉化率不大于1%，所有的SCR系統催化劑使煙氣中的SO2向SO3的轉化率與催化劑的體積均成相應比例，降低催化劑的用量可減少SO3的形成。
因此，催化劑的設計就是要選取一定反應面積的催化劑，以滿足在設備煙氣出口的煙氣流量、溫度、壓力、成份等條件下達到脫硝效率、氨逃逸率等SCR基本性能的設計要求；而在灰分條件多變的環境下，其防堵和防磨損性能則是保證SCR設備長期安全和穩定運行的關鍵。
在防堵灰這一層面，對于一定的反應器截面，在相同的催化劑節距下，板式催化劑的通流面積，一般在85%以上，且其壁面夾角數量最少，最不容易堵灰；蜂窩式催化劑次之，其流通面積一般在80%左右，而且其每個催化劑壁面夾角都是90°直角，在惡劣的煙氣條件下，容易產生灰分搭橋而引起催化劑的堵塞，但在相同的設計條件下，適當選取大節距的蜂窩式催化劑，其防堵效果可接近板式催化劑；波紋板式催化劑的流通面積與蜂窩式催化劑相近，但因其壁面夾角很小且數量又相對較多，為三種結構中非常容易積灰的版型，不過其抗中毒性能和抗二氧化硫氧化性能很強。
