機械柵通常采用間歇式的清除裝置，其運行方式可用定時裝置控制操作，亦可根據格柵前后渠道水位差的隨動裝置控制操作。為保證設備的安全運行，機械除污機裝置應設超負荷自動保護裝置。 為了保證機械除污機的正常運轉，應制定詳細的維護檢修計劃，對設備的各部位進行定期檢查維修并認真做好檢修記錄，如軸承減速器、鏈條的潤滑情況，傳動皮帶或鏈條的松緊程度，控制操作的定時裝置或水位差的傳感裝置是否正常等，及時更換損壞的零部件。 一般情況下，傳動鏈條應每兩月用鈣基脂潤滑一次。齒輪電機的滾珠軸承每工作10000h或一年后，需進行清洗并重新填注潤滑脂。齒輪箱每工作20000h或兩年應換油一次，潤滑油推薦產品為國產長城90重負荷齒輪油，運行過程中還應經常檢查齒輪箱油位。齒輪箱軸承每工作10000h后也必須清洗并填裝潤滑油，用量為軸承空間的三分之二。 當機械除污機出現故障或停機檢修時，應采用人工方式清污。
