PLANTaid 植物 RNA 助提劑
貨號 | 規格 | 分類 |
XG-P2718 | 5ml×2 | 核酸純化 |
保存條件:常溫運輸,室溫或者 4℃可保存 6 個月。
產品介紹:
植物助提劑 PLANTaid 是針對植物 RNA 提取時,針對富含多糖多酚等不容易清除的特點設計的一種多糖多酚植物 RNA 提取的輔助劑,主要成份為聚乙烯吡咯烷酮等高分子化合物。它們可以和多糖多酚等雜質結合,通過離心去除。它和絕大多數常用的使用高離序鹽(chaotropic salts )如異硫氰酸胍的 RNA 提取方法兼容。使用方法簡便,只要在正常的 RNA 提取步驟中加一步驟即可。將 PLANTaid 加入裂解液后,研磨,勻漿,PLANTaid 和多糖多酚等雜質結合,離心將 PLANTaid,多糖多酚和任何不溶解的雜質去除,取上清就可以繼續后面的正常RNA 提取步驟。
注意事項:
1.PLANTaid使用過量可能降低RNA產量,由于不同植物中所含多糖,多酚量變異性很大,因此用量應該在實驗中適當調整。
2.如果處理的植物量特別少,按照下面比例計算所需裂解液+PLANTaid 總體積少于200μl的情況下應該使用不少于200μl的總體積
來提取植物RNA,具體為175μl裂解液+25μl PLANTaid= 200μl。
使用方法:
1.估計待處理植物體積的方法,我們按照100mg/100μl的比例來估計待處理植物體積。
2.查看使用的RNA提取手冊(方法)的裂解液和植物處理量之間的比例
如果裂解液:植物處理量(體積比)≤9:1,則在所需裂解液中加入九分之一裂解液體積的PLANTaid;
如果裂解液:植物處理量(體積比)>9:1,則在所需裂解液中加入和植物處理量等體積的PLANTaid。
3.舉例說明:
1)如果RNA提取手冊上面裂解液:植物處理量=5:1,植物處理量為100mg(我們認為體積為100μl),所需裂解液為100μl×5= 500μl,
再加入500μl×1/9=55.6μl的PLANTaid. 2)如果RNA提取手冊上面裂解液:植物處理量=10:1, 植物處理量為100mg(我們認為體積為100μl),所需裂解液為100μl×10 = 1000μl,再加入100μl即和植物處理量等體積的PLANTaid。
3)使用上面的混和液按照正常操作步驟研磨,勻漿處理后,將裂解物用速(12000-14000rpm)室溫下離心5 sec。不溶的細胞碎片,PLANTaid和它結合的多糖多酚等雜質可以通過此離心步驟去除。
一、模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成 等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;
五、PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;
六、酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。
七、MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。
八、DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產物;
①Oligo dT
選擇Oligo dT時,要求RNA必須有Poly A,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,對RNA樣品的質量要求較高,不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應,建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機引物和特異性引物的穩定性要好。
②隨機引物
適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達量很低)。選擇隨機引物時,鏈cDNA合成反應中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應時設計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關系,一般建議每5µg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5µg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導致小片段產物(<500bp)的增加和長片段、全長產物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物(GSP)是某個基因序列的一部分,與模板互補的引物。該引物需要結合目標RNA的已知序列進行設計。由于引物和RNA序列特異性結合,每個目標RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此,當分析多種目標時,則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物,建議對退火溫度進行優化。
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