Hi T7 RNA Polymerase

描述：Hi T7 RNA Polymerase 對 T7 噬菌體啟動子具有高 度的特異性，并可以其作為啟動子，DNA 作為模板體外 合成正義鏈。雙鏈線性質粒 DNA、PCR 產物均可作為該 酶的底物模板。 Hi T7 RNA 聚合酶經電子重構架及庫篩選，與 Wild 型比較來看，酶的 DNA 模板結合區域親和力更高，使其 具有持續合成能力，從而獲得更高的產量，并易于長片段 RNA 的合成。該酶為重組純化制品，無 DNase 和 RNase 污染。

活性定義：在標準反應體系下，37℃ 1 小時內將 1 nmol的 ATP 摻入酸不溶物所需要的酶量定義為一個活性單位。
儲存：置于-20°C 可保存 2 年，如有白色沉淀析出，37°C溫浴 5min 后使用，不影響性能。
熱失活：75°C，10min。
操作方法
1.配制反應體系
10XHi T7 TransBuffer 2 μl
rNTP Mixture (25 mM each) 3.2 μl
Linearized template DNA 0.5-1 μg
RNase Inhibitor （40U/μl） 0.5 μl
Hi T7 RNA Polymerase (100 U/μl) 0.5-1 μl
DEPC-treated Water up to 20 μl
2. 37℃孵育 2-3h (通常 3h，即可獲得>80 μg 的總產量)。
3. 反應完畢后，如需去除模板 DNA，加入 Dnase I（2U）37℃處理 15min。
4. 終止反應：75℃加熱 10min，或加入 2 μl 0.5M 的 EDTA(pH8.0)。
注意事項
1.質粒DNA的質量影響RNA的量和完整性。質粒DNA的濃度越高，生成RNA的質量越高，質粒模板DNA應該無RNase污染.
2.該酶為高產酶，RNA 產量高，在反應完畢后，通常存在肉眼可見的渾濁狀態，其為反應副產物焦磷酸鎂，此時表明反應劇烈。在下一步 RNA 純化前，可通過短暫離心去除沉淀物，此過程并不丟失 RNA。
3. 通常轉錄后 RNA 產物濃度在 2-4 μg/μl，因此電泳時，僅需取 0.05-0.1 μl 即可。
4. 關于 T7 啟動子序列：（G/C）標示 G 或 C 堿基均可。

一、模板DNA：PCR反應需要模板DNA，如從細胞、組織、血液中提取DNA等；

二、引物：PCR反應的兩個引物，分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區域，引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物；

三、dNTPs：PCR反應中需要四種dNTPs，包括脫氧腺苷酸（dATP）、脫氧胸苷酸（dCTP）、脫氧鳥苷酸（dGTP）、脫氧胞嘧啶酸（dTTP），用于細胞分裂、DNA合成         等生物學過程，用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增；

四、Taq DNA聚合酶：PCR反應需要的聚合酶，一般使用Taq聚合酶，還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等，用于擴增DNA鏈；

五、PCR buffer溶液：對PCR反應具有緩沖作用，調節反應pH，硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛，可增強PCR反應特異性，從而提高反應效率；

六、酶切體系：PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟，常常需要進行酶切操作。

七、MARK:一種分子量標準，用來判別DNA片段大小的工具。

八、DNA純化試劑盒：用于純化PCR反應產物；

①Oligo dT
選擇Oligo dT時，要求RNA必須有Poly A，所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT，對RNA樣品的質量要求較高，不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應，建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機引物和特異性引物的穩定性要好。
②隨機引物
適合各種RNA的RT，尤其適合模板豐度很低的情況（比如某個gene表達量很低）。選擇隨機引物時，鏈cDNA合成反應中就是以所有的RNA為模板，然后進行PCR反應時設計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關系，一般建議每5µg總RNA的隨機引物的用量為50ng，如果每5µg總RNA的隨機引物的用量超過250ng，可能會導致小片段產物（＜500bp）的增加和長片段、全長產物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物（GSP）是某個基因序列的一部分，與模板互補的引物。該引物需要結合目標RNA的已知序列進行設計。由于引物和RNA序列特異性結合，每個目標RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此，當分析多種目標時，則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同，所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物，建議對退火溫度進行優化。