現階段，國內醫院對污水處理的主要有兩種方法：利用消毒劑進行消毒之后將其排入市政下水道。第二，通過一體化醫療污水處理設備對污水采取生化處理并在消毒之后向自然水體中排放。這兩種污水處理方式的主要特點表現在：首先，病原微生物濃度較高，醫療單位對污水的消毒達不到合格標準。尤其大多醫院在規模縮小、等級降低之后，其消毒方法、一體化醫療污水處理設備以及自我檢測方面的完善程度也呈現遞減趨勢。其次，消毒過程中主要以氯為主。國內大多地區目標所采用的一般為一級或二級處理加氯消毒、次氯酸鈉消毒劑或者利用二氧化氯進行消毒。第三，消毒劑投加量過量或不足的情況比較常見。一部分醫院為保證殺菌比較*，使用過量的消毒劑，也有部分醫院為節約成本，投加量明顯不足，達不到良好的消毒效果。
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