廢水處理設備一體化工藝雖有許多優點，但也有一定的適用范圍。在選擇該工藝時應該考慮以下問題：
（1）進水BOD濃度較高時，建議考慮采用兩級工藝。本文介紹的是單級工藝，即進水只經過一級生物池處理，當進水水質較高時，如BOD高于500mg/L時，可采用兩級工藝，即用兩級生物池處理，級生物池按高負荷厭氧或好氧方式運行，第二級按低負荷好氧方式運行。
（2）出水水質有除磷要求時，應慎重考慮是否選用廢水處理設備一體化工藝。因為該工藝由于沒有一個*的厭氧區，較難形成生物除磷的理想厭氧狀態。該工藝除磷脫氮過程的原理是：通過在沉淀末期和曝氣期中間加入非曝氣攪拌期，形成缺氧和厭氧狀態，完成脫氮和生物除磷功能。
通過對該系統進行靈活的時間和空間控制，適當地增大水力停留時間，可以實現污水的脫氮除磷。
污水交替進入左側池和中間池，左側池作為缺氧攪拌反應器，以污水中的有機物為電子供體，將在前一個主體運行階段的硝態氮通過兼性菌的反硝化作用實現脫氮；然后釋放上一階段運行時沉淀的含磷污泥中的磷。
中間池曝氣運行時，去除有機物，進行硝化及吸收磷；進水并攪拌時，可以進行反硝化脫氮，同時污泥也由左向右推進。右側池進行沉淀，泥水分離，上清液作為處理水溢出，含磷污泥的一部分作為剩余污泥排放。在進入第二個主體運行階段前，污水只進入中間池，使左側池中盡可能完成硝化反應。其后左側池停止曝氣，作為沉淀池。然后進入第二個主體運行階段，污水流動方向由右向左，運行過程相同。
